More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3772 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  59.46 
 
 		 835 aa  798    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  58.24 
 
 		 715 aa  790    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  58.45 
 
 		 862 aa  786    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 708 aa  1444    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  60.26 
 
 		 706 aa  820    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  57.31 
 
 		 691 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  50.07 
 
 		 715 aa  647    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  56.68 
 
 		 883 aa  792    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  55.3 
 
 		 715 aa  715    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  53.25 
 
 		 741 aa  715    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  57.75 
 
 		 761 aa  820    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  56.58 
 
 		 698 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  51.03 
 
 		 732 aa  684    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  57.54 
 
 		 699 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  49.18 
 
 		 738 aa  649    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  58.27 
 
 		 714 aa  804    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  50.42 
 
 		 733 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.98 
 
 		 766 aa  667    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.35 
 
 		 704 aa  780    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  57.65 
 
 		 680 aa  761    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  52.57 
 
 		 741 aa  679    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  58.87 
 
 		 677 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  45.36 
 
 		 709 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  41 
 
 		 1173 aa  473  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.77 
 
 		 677 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.83 
 
 		 674 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.29 
 
 		 674 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 906 aa  468  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.29 
 
 		 674 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  37.55 
 
 		 695 aa  465  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.74 
 
 		 687 aa  463  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.15 
 
 		 674 aa  464  1e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  36.6 
 
 		 689 aa  462  9.999999999999999e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.97 
 
 		 686 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.18 
 
 		 917 aa  461  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 		 879 aa  461  9.999999999999999e-129  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 		 904 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.34 
 
 		 685 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  37.41 
 
 		 745 aa  447  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  37.32 
 
 		 716 aa  449  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  36.71 
 
 		 687 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.92 
 
 		 688 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.99 
 
 		 676 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 		 689 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.42 
 
 		 688 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.75 
 
 		 688 aa  443  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.76 
 
 		 676 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.93 
 
 		 688 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.85 
 
 		 676 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.41 
 
 		 886 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.72 
 
 		 727 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.47 
 
 		 901 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.96 
 
 		 900 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  37.03 
 
 		 746 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.3 
 
 		 911 aa  433  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.54 
 
 		 893 aa  434  1e-120  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.75 
 
 		 746 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.3 
 
 		 898 aa  435  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.98 
 
 		 937 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  38.43 
 
 		 899 aa  430  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.39 
 
 		 734 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.65 
 
 		 668 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  34.9 
 
 		 1171 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.34 
 
 		 903 aa  425  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 		 685 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 925 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.72 
 
 		 729 aa  422  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.65 
 
 		 718 aa  420  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 893 aa  422  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 762 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  36.49 
 
 		 724 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 686 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.62 
 
 		 893 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  35.39 
 
 		 1176 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.93 
 
 		 721 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  34.19 
 
 		 757 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  35.22 
 
 		 1188 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.77 
 
 		 920 aa  412  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.46 
 
 		 1110 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.06 
 
 		 754 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  34.38 
 
 		 713 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 		 945 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.01 
 
 		 900 aa  411  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 927 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.73 
 
 		 1111 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  34.1 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  35.12 
 
 		 734 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.1 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  34.1 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  34.13 
 
 		 734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.63 
 
 		 1406 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.1 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 		 724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 		 963 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 		 715 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  34.04 
 
 		 1180 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.75 
 
 		 662 aa  404  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 		 905 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 1130 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>