More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2801 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  62.27 
 
 
706 aa  815    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  65.2 
 
 
732 aa  900    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  57.2 
 
 
883 aa  694    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  62.02 
 
 
699 aa  748    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  60.65 
 
 
698 aa  739    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  62.4 
 
 
715 aa  798    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  57.4 
 
 
761 aa  764    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
715 aa  1404    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  57.62 
 
 
862 aa  712    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  55.3 
 
 
708 aa  717    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  61.12 
 
 
714 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  56.68 
 
 
835 aa  725    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  60.2 
 
 
677 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  59.07 
 
 
738 aa  765    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  76.19 
 
 
741 aa  1030    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  58.02 
 
 
733 aa  768    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  55.12 
 
 
741 aa  694    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  63.39 
 
 
691 aa  807    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.61 
 
 
704 aa  692    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  60.54 
 
 
680 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.44 
 
 
766 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  45.07 
 
 
715 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  46.53 
 
 
709 aa  520  1e-146  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.32 
 
 
676 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.6 
 
 
676 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.71 
 
 
674 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 
674 aa  410  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.54 
 
 
904 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.6 
 
 
676 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 
674 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.96 
 
 
886 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 
674 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.97 
 
 
925 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.66 
 
 
879 aa  399  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.99 
 
 
1110 aa  398  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 
677 aa  398  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.08 
 
 
695 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.99 
 
 
687 aa  392  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.47 
 
 
689 aa  392  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  33.98 
 
 
734 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  34.86 
 
 
734 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  33.38 
 
 
689 aa  388  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.85 
 
 
688 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.46 
 
 
727 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.76 
 
 
688 aa  389  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.13 
 
 
905 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.79 
 
 
685 aa  387  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 
688 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.53 
 
 
1111 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.99 
 
 
668 aa  383  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.05 
 
 
917 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.21 
 
 
729 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  34.04 
 
 
716 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  35.78 
 
 
762 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 
893 aa  378  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.18 
 
 
906 aa  377  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 
900 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  35.89 
 
 
899 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 
686 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.15 
 
 
687 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 
901 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 
662 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.1 
 
 
961 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.57 
 
 
893 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.52 
 
 
1130 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  37.34 
 
 
1173 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 
937 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.68 
 
 
686 aa  371  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.31 
 
 
754 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.12 
 
 
988 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.24 
 
 
963 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.12 
 
 
988 aa  367  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  35.23 
 
 
746 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 
945 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.02 
 
 
898 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.02 
 
 
688 aa  365  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.03 
 
 
988 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.47 
 
 
900 aa  364  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.86 
 
 
685 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  36.59 
 
 
744 aa  362  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.16 
 
 
745 aa  362  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  34.96 
 
 
746 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 
989 aa  361  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 
989 aa  361  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  36.34 
 
 
752 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  37.09 
 
 
906 aa  359  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.47 
 
 
911 aa  358  9.999999999999999e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.84 
 
 
957 aa  359  9.999999999999999e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.97 
 
 
942 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.86 
 
 
955 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  36.2 
 
 
752 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.87 
 
 
924 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.13 
 
 
724 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  36.07 
 
 
752 aa  356  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 
920 aa  356  8.999999999999999e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  37.77 
 
 
1405 aa  355  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.78 
 
 
963 aa  355  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.8 
 
 
989 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.24 
 
 
727 aa  353  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.2 
 
 
893 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>