More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0863 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  62.41 
 
 		 835 aa  845    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  63.01 
 
 		 677 aa  855    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  62.29 
 
 		 714 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  67.04 
 
 		 706 aa  945    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  57.2 
 
 		 715 aa  765    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  52.47 
 
 		 738 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.17 
 
 		 766 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  60.92 
 
 		 698 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  57.59 
 
 		 708 aa  823    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  100 
 
 		 761 aa  1524    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  65.32 
 
 		 691 aa  902    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  57.98 
 
 		 741 aa  764    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  57.67 
 
 		 699 aa  737    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  62.59 
 
 		 715 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  61.8 
 
 		 883 aa  820    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  52.41 
 
 		 733 aa  683    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  55.17 
 
 		 741 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  58.33 
 
 		 862 aa  803    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.38 
 
 		 704 aa  761    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  61.76 
 
 		 680 aa  821    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  54.18 
 
 		 732 aa  715    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  46.79 
 
 		 715 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  44.84 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.36 
 
 		 677 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.75 
 
 		 687 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.86 
 
 		 729 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.75 
 
 		 695 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.56 
 
 		 688 aa  444  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.59 
 
 		 674 aa  444  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.79 
 
 		 886 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.83 
 
 		 689 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.97 
 
 		 688 aa  436  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.99 
 
 		 674 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.9 
 
 		 917 aa  431  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.42 
 
 		 674 aa  431  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.84 
 
 		 676 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.7 
 
 		 676 aa  424  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.14 
 
 		 674 aa  426  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.56 
 
 		 676 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.13 
 
 		 686 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.46 
 
 		 734 aa  421  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.56 
 
 		 879 aa  420  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.29 
 
 		 724 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.66 
 
 		 727 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  38.55 
 
 		 1173 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.63 
 
 		 688 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.6 
 
 		 688 aa  415  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  35.37 
 
 		 757 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.78 
 
 		 662 aa  414  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 716 aa  412  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  34.17 
 
 		 687 aa  412  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 904 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.12 
 
 		 685 aa  410  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.99 
 
 		 689 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 		 901 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.75 
 
 		 911 aa  405  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.56 
 
 		 893 aa  402  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.76 
 
 		 686 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 		 1171 aa  402  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  33.51 
 
 		 734 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.41 
 
 		 746 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.01 
 
 		 745 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  36.14 
 
 		 746 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.75 
 
 		 925 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 		 900 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.41 
 
 		 727 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.51 
 
 		 906 aa  390  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 744 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.57 
 
 		 1130 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 		 754 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 		 685 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  34.15 
 
 		 734 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.67 
 
 		 1111 aa  388  1e-106  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.99 
 
 		 1110 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  35.78 
 
 		 752 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  35.69 
 
 		 1396 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.74 
 
 		 743 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  35.45 
 
 		 899 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  34.77 
 
 		 958 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 924 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  38.66 
 
 		 1370 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.98 
 
 		 933 aa  380  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.14 
 
 		 927 aa  381  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 1312 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  36.73 
 
 		 1232 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  36.59 
 
 		 906 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 		 955 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  35.95 
 
 		 915 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  32.22 
 
 		 713 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  35.95 
 
 		 915 aa  379  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.66 
 
 		 893 aa  379  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.46 
 
 		 906 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 		 752 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.93 
 
 		 898 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  32.41 
 
 		 1176 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  36.42 
 
 		 1394 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  35.46 
 
 		 752 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  31.9 
 
 		 1228 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  35.9 
 
 		 1405 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  34.74 
 
 		 1384 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>