More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1746 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  53.61 
 
 
715 aa  685    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  56.01 
 
 
699 aa  720    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  56.35 
 
 
708 aa  775    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  53.97 
 
 
698 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  59.56 
 
 
706 aa  785    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  57.49 
 
 
835 aa  723    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  52.49 
 
 
741 aa  669    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.53 
 
 
761 aa  752    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  56.92 
 
 
715 aa  745    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  54.72 
 
 
677 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  57.75 
 
 
691 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  51.73 
 
 
741 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  48.7 
 
 
732 aa  636    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  55.6 
 
 
883 aa  689    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  100 
 
 
704 aa  1416    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.35 
 
 
680 aa  719    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  56.24 
 
 
862 aa  718    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  57.94 
 
 
714 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  49.37 
 
 
733 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  48.23 
 
 
715 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  49.93 
 
 
738 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.57 
 
 
766 aa  600  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  42.88 
 
 
709 aa  483  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.26 
 
 
677 aa  422  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  34.87 
 
 
716 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  38.18 
 
 
1173 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.91 
 
 
689 aa  411  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.33 
 
 
688 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.5 
 
 
687 aa  410  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.49 
 
 
734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  35.49 
 
 
724 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.58 
 
 
674 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 
688 aa  403  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.06 
 
 
729 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.81 
 
 
687 aa  405  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
674 aa  405  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.45 
 
 
727 aa  402  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.25 
 
 
686 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.81 
 
 
688 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 
674 aa  399  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 
674 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  33.48 
 
 
1171 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.15 
 
 
917 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.05 
 
 
695 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 
685 aa  392  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.77 
 
 
676 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.22 
 
 
886 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 
688 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  33.94 
 
 
746 aa  382  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.05 
 
 
901 aa  379  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 
1188 aa  380  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  32.91 
 
 
734 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.9 
 
 
676 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  35.94 
 
 
744 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  33.85 
 
 
757 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 
676 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 
754 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.56 
 
 
689 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.57 
 
 
1130 aa  373  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 
746 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.44 
 
 
1111 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 
933 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.88 
 
 
879 aa  373  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 
900 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.77 
 
 
963 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.11 
 
 
904 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.81 
 
 
898 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.68 
 
 
924 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.89 
 
 
727 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  33.62 
 
 
734 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  32.86 
 
 
1176 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.4 
 
 
668 aa  372  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.49 
 
 
662 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 
1180 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  31.71 
 
 
1228 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.16 
 
 
920 aa  369  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 
724 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  32.59 
 
 
745 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 
686 aa  365  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.01 
 
 
945 aa  366  1e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.55 
 
 
906 aa  365  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 
1110 aa  364  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.91 
 
 
937 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.32 
 
 
893 aa  362  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.95 
 
 
961 aa  362  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 
963 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.37 
 
 
986 aa  361  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.67 
 
 
925 aa  360  4e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.67 
 
 
957 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  33.79 
 
 
1384 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.6 
 
 
893 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.57 
 
 
687 aa  357  5e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.74 
 
 
685 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.11 
 
 
952 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.38 
 
 
942 aa  355  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  33.76 
 
 
908 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.66 
 
 
899 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  31.65 
 
 
1385 aa  353  5.9999999999999994e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.04 
 
 
1232 aa  353  8e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  34.52 
 
 
964 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>