More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2676 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  49.21 
 
 
706 aa  643    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.35 
 
 
766 aa  640    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
715 aa  1480    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  50.07 
 
 
708 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  48.23 
 
 
704 aa  629  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  48.57 
 
 
862 aa  621  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  48.21 
 
 
714 aa  609  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  47.89 
 
 
691 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  48.7 
 
 
835 aa  605  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  47.09 
 
 
761 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  48.62 
 
 
883 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  48.15 
 
 
715 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  47.83 
 
 
699 aa  582  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  48.06 
 
 
677 aa  581  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  47.08 
 
 
680 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  46.97 
 
 
698 aa  568  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  45.07 
 
 
715 aa  560  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  44.02 
 
 
741 aa  547  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  42.94 
 
 
709 aa  530  1e-149  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  42.6 
 
 
732 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  42.48 
 
 
741 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  42.46 
 
 
738 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.35 
 
 
733 aa  496  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  36.78 
 
 
687 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.94 
 
 
688 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.55 
 
 
677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.41 
 
 
674 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 
920 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.4 
 
 
688 aa  450  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.83 
 
 
674 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.93 
 
 
674 aa  450  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.68 
 
 
674 aa  449  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 
687 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.51 
 
 
917 aa  442  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.69 
 
 
686 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.96 
 
 
689 aa  436  1e-121  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  36.32 
 
 
695 aa  434  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.92 
 
 
688 aa  434  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.03 
 
 
676 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 
676 aa  423  1e-117  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.83 
 
 
685 aa  424  1e-117  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.47 
 
 
893 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.98 
 
 
734 aa  420  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  34.24 
 
 
757 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.86 
 
 
904 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  35.55 
 
 
1171 aa  416  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 
676 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 
689 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  34.54 
 
 
746 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 
724 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 
879 aa  415  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.01 
 
 
898 aa  413  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  34.54 
 
 
746 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.94 
 
 
727 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.53 
 
 
901 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  35.77 
 
 
745 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.54 
 
 
668 aa  409  1e-113  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.21 
 
 
900 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 
688 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  35.88 
 
 
744 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.61 
 
 
686 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 
886 aa  403  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  35.7 
 
 
1173 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.78 
 
 
685 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  34.27 
 
 
1176 aa  397  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.73 
 
 
662 aa  398  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.09 
 
 
893 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.27 
 
 
729 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  35.77 
 
 
899 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 
724 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.71 
 
 
1110 aa  390  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.9 
 
 
933 aa  392  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.05 
 
 
925 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.9 
 
 
937 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.78 
 
 
924 aa  385  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.95 
 
 
1111 aa  385  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.72 
 
 
900 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.94 
 
 
988 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 
988 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  33.43 
 
 
716 aa  385  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.99 
 
 
721 aa  381  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 
1228 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  35.02 
 
 
762 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.99 
 
 
743 aa  381  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  32.77 
 
 
1180 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.8 
 
 
988 aa  382  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.47 
 
 
924 aa  382  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.52 
 
 
929 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 
754 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.04 
 
 
904 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  33.95 
 
 
734 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.15 
 
 
945 aa  378  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.99 
 
 
718 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 
963 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.77 
 
 
961 aa  375  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.06 
 
 
929 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 
994 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.91 
 
 
927 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  35.03 
 
 
908 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 
893 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>