More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4160 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  82.48 
 
 
1111 aa  1880    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 
986 aa  682    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.53 
 
 
879 aa  654    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
1110 aa  2277    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.71 
 
 
754 aa  837    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.22 
 
 
984 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.03 
 
 
901 aa  637    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.64 
 
 
1130 aa  1355    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.93 
 
 
917 aa  652    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.22 
 
 
984 aa  652    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.96 
 
 
904 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.73 
 
 
886 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  47.38 
 
 
899 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.53 
 
 
893 aa  630  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.45 
 
 
900 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.49 
 
 
893 aa  623  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  36 
 
 
987 aa  624  1e-177  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.21 
 
 
980 aa  617  1e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.15 
 
 
978 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 
980 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  37.45 
 
 
978 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.35 
 
 
978 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.35 
 
 
978 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  37.35 
 
 
978 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.08 
 
 
920 aa  613  9.999999999999999e-175  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.87 
 
 
978 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  37.25 
 
 
978 aa  611  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.87 
 
 
978 aa  611  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.7 
 
 
893 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.87 
 
 
978 aa  611  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.07 
 
 
1012 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.19 
 
 
1440 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.15 
 
 
979 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  35.15 
 
 
979 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.86 
 
 
979 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.86 
 
 
979 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.96 
 
 
979 aa  601  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.95 
 
 
979 aa  600  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.86 
 
 
979 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  43.88 
 
 
745 aa  602  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.29 
 
 
1440 aa  601  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.77 
 
 
979 aa  598  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.4 
 
 
677 aa  597  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.94 
 
 
1421 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.78 
 
 
1428 aa  590  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.69 
 
 
1425 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.95 
 
 
898 aa  589  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.56 
 
 
1425 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.86 
 
 
1004 aa  589  1e-167  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.52 
 
 
973 aa  589  1e-166  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  44.81 
 
 
695 aa  588  1e-166  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.86 
 
 
688 aa  589  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.36 
 
 
979 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.54 
 
 
933 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.84 
 
 
987 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.14 
 
 
900 aa  586  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.47 
 
 
1424 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.57 
 
 
1432 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.76 
 
 
1425 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.31 
 
 
1432 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.44 
 
 
1432 aa  582  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.7 
 
 
686 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.94 
 
 
905 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.29 
 
 
911 aa  577  1.0000000000000001e-163  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.7 
 
 
674 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.56 
 
 
1410 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.62 
 
 
674 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.31 
 
 
687 aa  572  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 
674 aa  570  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 
906 aa  571  1e-161  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.47 
 
 
674 aa  572  1e-161  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.54 
 
 
689 aa  572  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.58 
 
 
988 aa  570  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.15 
 
 
688 aa  570  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.96 
 
 
1385 aa  568  1e-160  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  42.52 
 
 
1412 aa  569  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.51 
 
 
929 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.1 
 
 
903 aa  564  1.0000000000000001e-159  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  42.38 
 
 
1387 aa  560  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.48 
 
 
1426 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.44 
 
 
988 aa  562  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.44 
 
 
988 aa  562  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.86 
 
 
994 aa  561  1e-158  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.09 
 
 
989 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.41 
 
 
985 aa  559  1e-157  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.01 
 
 
676 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.14 
 
 
688 aa  557  1e-157  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.76 
 
 
1406 aa  559  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 
989 aa  555  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 
989 aa  553  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 
989 aa  555  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.65 
 
 
945 aa  555  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.26 
 
 
924 aa  554  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 
676 aa  551  1e-155  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.72 
 
 
676 aa  552  1e-155  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  40.95 
 
 
687 aa  547  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 
688 aa  548  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.6 
 
 
924 aa  542  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.31 
 
 
925 aa  536  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  40.2 
 
 
716 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>