More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2414 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  60.26 
 
 		 708 aa  810    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  63.68 
 
 		 835 aa  851    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.38 
 
 		 766 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  62.27 
 
 		 715 aa  805    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  49.21 
 
 		 715 aa  636    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  67.18 
 
 		 761 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  59.44 
 
 		 741 aa  776    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  62.28 
 
 		 699 aa  779    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  64.86 
 
 		 714 aa  864    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 706 aa  1412    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  57.85 
 
 		 741 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  66.23 
 
 		 883 aa  850    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 		 732 aa  753    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  63.17 
 
 		 698 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  72.7 
 
 		 691 aa  964    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  55.94 
 
 		 733 aa  708    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  62.18 
 
 		 862 aa  810    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  59.56 
 
 		 704 aa  785    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  62.32 
 
 		 680 aa  811    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  65.36 
 
 		 677 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  65.11 
 
 		 715 aa  858    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  56.17 
 
 		 738 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 		 709 aa  535  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.87 
 
 		 677 aa  479  1e-134  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.48 
 
 		 674 aa  481  1e-134  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 674 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  38.44 
 
 		 695 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.46 
 
 		 674 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 		 674 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.75 
 
 		 886 aa  462  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.01 
 
 		 687 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.72 
 
 		 676 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  36.92 
 
 		 689 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.03 
 
 		 688 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 		 904 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 		 917 aa  451  1e-125  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.92 
 
 		 893 aa  449  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.74 
 
 		 689 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  41.22 
 
 		 1173 aa  451  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 		 676 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  40.12 
 
 		 899 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.16 
 
 		 686 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.06 
 
 		 688 aa  443  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  35.91 
 
 		 1171 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.61 
 
 		 901 aa  442  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.6 
 
 		 686 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.43 
 
 		 676 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.7 
 
 		 688 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.77 
 
 		 898 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.28 
 
 		 662 aa  438  1e-121  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.51 
 
 		 688 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.42 
 
 		 925 aa  432  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  37.06 
 
 		 745 aa  432  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.9 
 
 		 879 aa  430  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.12 
 
 		 668 aa  427  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 		 1110 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.23 
 
 		 906 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.27 
 
 		 893 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.32 
 
 		 900 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  37.72 
 
 		 716 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.82 
 
 		 734 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 		 893 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.93 
 
 		 911 aa  421  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.95 
 
 		 1130 aa  419  1e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  35.76 
 
 		 687 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.79 
 
 		 1111 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.03 
 
 		 937 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.17 
 
 		 961 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  37.66 
 
 		 746 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.68 
 
 		 729 aa  415  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.48 
 
 		 727 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 		 945 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.05 
 
 		 715 aa  413  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.94 
 
 		 927 aa  412  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  34.05 
 
 		 715 aa  413  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 715 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.36 
 
 		 900 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  33.9 
 
 		 715 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 715 aa  412  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  33.9 
 
 		 715 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  38.35 
 
 		 906 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.97 
 
 		 903 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  34.72 
 
 		 1176 aa  410  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.04 
 
 		 957 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 		 963 aa  412  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  37.34 
 
 		 908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.18 
 
 		 727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  37.66 
 
 		 746 aa  409  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  35.34 
 
 		 757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.82 
 
 		 924 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  34.91 
 
 		 715 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.62 
 
 		 988 aa  405  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  37.83 
 
 		 908 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.68 
 
 		 724 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.19 
 
 		 963 aa  402  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.45 
 
 		 942 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.77 
 
 		 988 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 		 715 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>