More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1821 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  76.21 
 
 		 715 aa  1058    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  56.93 
 
 		 738 aa  730    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  59.78 
 
 		 698 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  59.94 
 
 		 677 aa  751    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  58.21 
 
 		 761 aa  785    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  60.36 
 
 		 691 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  59.48 
 
 		 706 aa  805    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 741 aa  1450    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  58.17 
 
 		 699 aa  731    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  56.28 
 
 		 883 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  64.74 
 
 		 732 aa  898    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  52.65 
 
 		 741 aa  671    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  54.97 
 
 		 862 aa  697    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  57.84 
 
 		 733 aa  757    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  57.7 
 
 		 715 aa  752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  52.19 
 
 		 704 aa  692    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  55.8 
 
 		 835 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  58.57 
 
 		 680 aa  736    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  52.49 
 
 		 708 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  59.25 
 
 		 714 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.1 
 
 		 766 aa  559  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  42.54 
 
 		 715 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  44.38 
 
 		 709 aa  511  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.78 
 
 		 886 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.74 
 
 		 900 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 		 674 aa  405  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  35.45 
 
 		 716 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.05 
 
 		 917 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.94 
 
 		 676 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.08 
 
 		 906 aa  402  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.92 
 
 		 904 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.94 
 
 		 676 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.56 
 
 		 674 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.4 
 
 		 687 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.52 
 
 		 676 aa  394  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.84 
 
 		 674 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.1 
 
 		 688 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.47 
 
 		 727 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.42 
 
 		 674 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  33.43 
 
 		 695 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.8 
 
 		 677 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.17 
 
 		 911 aa  383  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 		 688 aa  384  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.79 
 
 		 689 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 1110 aa  382  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.78 
 
 		 689 aa  380  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.41 
 
 		 745 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.06 
 
 		 688 aa  377  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.96 
 
 		 662 aa  379  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.49 
 
 		 879 aa  377  1e-103  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  32.62 
 
 		 734 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.78 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  36.89 
 
 		 744 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.1 
 
 		 687 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.73 
 
 		 905 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  32.93 
 
 		 734 aa  372  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.38 
 
 		 668 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 1173 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.94 
 
 		 925 aa  369  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.14 
 
 		 937 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.41 
 
 		 899 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  32.73 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.17 
 
 		 893 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.73 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  32.73 
 
 		 715 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 715 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.32 
 
 		 686 aa  365  1e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  32.6 
 
 		 715 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  32.6 
 
 		 715 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.27 
 
 		 888 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 		 945 aa  363  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.18 
 
 		 893 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.64 
 
 		 920 aa  361  3e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  33.65 
 
 		 746 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 		 1111 aa  357  3.9999999999999996e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  33.97 
 
 		 724 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  33.51 
 
 		 746 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  32.97 
 
 		 734 aa  353  5.9999999999999994e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  35.11 
 
 		 915 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  35.11 
 
 		 915 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 		 1171 aa  353  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.95 
 
 		 900 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.9 
 
 		 955 aa  352  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.89 
 
 		 901 aa  352  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.68 
 
 		 898 aa  351  3e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.68 
 
 		 743 aa  350  4e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.41 
 
 		 1130 aa  350  5e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.15 
 
 		 727 aa  350  6e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  34.78 
 
 		 743 aa  350  6e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.65 
 
 		 988 aa  350  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.65 
 
 		 988 aa  350  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 724 aa  350  6e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  32.43 
 
 		 899 aa  350  7e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.33 
 
 		 907 aa  350  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  36.1 
 
 		 1232 aa  349  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 		 762 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 		 754 aa  348  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>