More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2167 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  53.41 
 
 		 738 aa  663    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  60.65 
 
 		 715 aa  757    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  56.73 
 
 		 699 aa  692    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  57.27 
 
 		 835 aa  728    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  70.09 
 
 		 677 aa  904    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  54.82 
 
 		 732 aa  708    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  64.45 
 
 		 691 aa  839    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  60.9 
 
 		 761 aa  812    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  58.7 
 
 		 862 aa  723    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  63.17 
 
 		 706 aa  826    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 698 aa  1384    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  59.37 
 
 		 715 aa  748    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  58.94 
 
 		 714 aa  755    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  60.11 
 
 		 741 aa  729    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.11 
 
 		 733 aa  687    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  55.8 
 
 		 741 aa  714    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.97 
 
 		 704 aa  671    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  61.45 
 
 		 680 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  59.02 
 
 		 883 aa  724    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  56.58 
 
 		 708 aa  737    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.21 
 
 		 766 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  46.97 
 
 		 715 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 		 709 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 		 917 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.04 
 
 		 677 aa  396  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 886 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.67 
 
 		 688 aa  399  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.45 
 
 		 879 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.38 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  33.57 
 
 		 689 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.77 
 
 		 674 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.06 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 		 674 aa  390  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.77 
 
 		 674 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  38.9 
 
 		 1173 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 		 900 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.2 
 
 		 674 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 		 687 aa  392  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  34.86 
 
 		 687 aa  389  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.29 
 
 		 695 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.29 
 
 		 688 aa  382  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.77 
 
 		 676 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.89 
 
 		 901 aa  378  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 		 676 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.77 
 
 		 676 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.82 
 
 		 685 aa  378  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 		 688 aa  373  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.4 
 
 		 668 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.61 
 
 		 920 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  37.29 
 
 		 906 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.34 
 
 		 729 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 893 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  36.74 
 
 		 899 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  35.24 
 
 		 716 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.94 
 
 		 718 aa  369  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.23 
 
 		 721 aa  369  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.2 
 
 		 925 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.97 
 
 		 904 aa  365  2e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 689 aa  364  3e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.32 
 
 		 888 aa  364  4e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.38 
 
 		 662 aa  363  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.69 
 
 		 988 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.69 
 
 		 988 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.99 
 
 		 933 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 686 aa  360  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.84 
 
 		 989 aa  361  3e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 		 734 aa  360  4e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  35.09 
 
 		 744 aa  360  4e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.97 
 
 		 898 aa  360  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  35.11 
 
 		 724 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  35.89 
 
 		 915 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  35.89 
 
 		 915 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.75 
 
 		 988 aa  359  8e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.4 
 
 		 989 aa  359  8e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 		 989 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.38 
 
 		 734 aa  356  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.33 
 
 		 937 aa  356  1e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 		 893 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33 
 
 		 727 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.61 
 
 		 989 aa  353  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.32 
 
 		 1110 aa  353  5.9999999999999994e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 		 924 aa  353  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  32.34 
 
 		 734 aa  351  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 		 961 aa  350  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.29 
 
 		 727 aa  350  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.76 
 
 		 724 aa  350  7e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  32.67 
 
 		 1180 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  35.73 
 
 		 908 aa  349  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  31.77 
 
 		 1171 aa  348  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  32.19 
 
 		 1228 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  31.95 
 
 		 1176 aa  347  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 685 aa  347  4e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 		 911 aa  347  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 		 963 aa  346  8e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.21 
 
 		 904 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 746 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  34.78 
 
 		 908 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  33.89 
 
 		 958 aa  345  2e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.81 
 
 		 906 aa  345  2e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.46 
 
 		 1384 aa  345  2e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>