More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3913 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  99.58 
 
 		 715 aa  1487    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 715 aa  1496    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.51 
 
 		 716 aa  1041    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.55 
 
 		 716 aa  1005    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.8 
 
 		 715 aa  976    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.09 
 
 		 716 aa  1025    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.64 
 
 		 808 aa  851    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  99.72 
 
 		 715 aa  1489    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  56.47 
 
 		 737 aa  843    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  63.53 
 
 		 713 aa  969    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  93.37 
 
 		 559 aa  1103    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  99.64 
 
 		 559 aa  1168    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  99.58 
 
 		 715 aa  1487    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.24 
 
 		 723 aa  959    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.41 
 
 		 716 aa  1007    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  99.72 
 
 		 715 aa  1489    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  64.76 
 
 		 716 aa  994    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.34 
 
 		 718 aa  1009    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  62.94 
 
 		 715 aa  976    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  62.8 
 
 		 715 aa  975    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  99.72 
 
 		 715 aa  1489    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.55 
 
 		 917 aa  591  1e-167  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  43.71 
 
 		 745 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.14 
 
 		 893 aa  591  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.27 
 
 		 893 aa  590  1e-167  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.63 
 
 		 676 aa  579  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.63 
 
 		 676 aa  581  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.15 
 
 		 674 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.38 
 
 		 674 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.97 
 
 		 676 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 677 aa  569  1e-161  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.71 
 
 		 674 aa  569  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.16 
 
 		 900 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.09 
 
 		 879 aa  567  1e-160  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  42.24 
 
 		 899 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.16 
 
 		 906 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.69 
 
 		 674 aa  559  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.53 
 
 		 901 aa  560  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.1 
 
 		 893 aa  557  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.62 
 
 		 904 aa  556  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.53 
 
 		 688 aa  555  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.83 
 
 		 695 aa  555  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 		 900 aa  555  1e-156  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.11 
 
 		 911 aa  551  1e-155  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  40.63 
 
 		 689 aa  550  1e-155  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.05 
 
 		 689 aa  544  1e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.11 
 
 		 686 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.45 
 
 		 724 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.71 
 
 		 945 aa  536  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.26 
 
 		 905 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.77 
 
 		 688 aa  531  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 		 687 aa  528  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.81 
 
 		 685 aa  527  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.11 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.59 
 
 		 1440 aa  521  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  40.31 
 
 		 687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 686 aa  513  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.7 
 
 		 898 aa  514  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.78 
 
 		 1385 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.27 
 
 		 925 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 688 aa  512  1e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.23 
 
 		 920 aa  511  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.04 
 
 		 903 aa  508  9.999999999999999e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.34 
 
 		 937 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 1410 aa  505  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 944 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 		 956 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.95 
 
 		 1406 aa  499  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.92 
 
 		 1000 aa  494  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 		 959 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.37 
 
 		 909 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 		 886 aa  491  1e-137  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.66 
 
 		 927 aa  490  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  37.12 
 
 		 977 aa  492  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 		 1440 aa  488  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.13 
 
 		 1421 aa  488  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.81 
 
 		 963 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 979 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.98 
 
 		 957 aa  486  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.25 
 
 		 1428 aa  485  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.6 
 
 		 983 aa  484  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.19 
 
 		 982 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.71 
 
 		 1424 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.12 
 
 		 967 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.31 
 
 		 956 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.13 
 
 		 1425 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.27 
 
 		 1425 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 		 933 aa  481  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.18 
 
 		 1425 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  39.22 
 
 		 1387 aa  482  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.03 
 
 		 947 aa  477  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.17 
 
 		 942 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.13 
 
 		 948 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.63 
 
 		 949 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 		 982 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.41 
 
 		 952 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.41 
 
 		 983 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 		 983 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 		 1432 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>