More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2244 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  59.46 
 
 		 708 aa  790    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  55.6 
 
 		 741 aa  689    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  57.16 
 
 		 715 aa  716    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  62.55 
 
 		 862 aa  969    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  60.54 
 
 		 715 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  59.94 
 
 		 714 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  62.74 
 
 		 761 aa  824    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  60.57 
 
 		 691 aa  790    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  67.06 
 
 		 883 aa  1091    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  58.08 
 
 		 677 aa  736    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  52.69 
 
 		 738 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  57.27 
 
 		 698 aa  701    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  63.68 
 
 		 706 aa  851    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  55.1 
 
 		 732 aa  699    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 835 aa  1682    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.65 
 
 		 733 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  55.81 
 
 		 741 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  56.55 
 
 		 699 aa  693    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  57.49 
 
 		 704 aa  722    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  60.63 
 
 		 680 aa  764    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.15 
 
 		 766 aa  629  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  48.7 
 
 		 715 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  46.77 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.87 
 
 		 886 aa  439  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  36.48 
 
 		 695 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.59 
 
 		 677 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  39.46 
 
 		 899 aa  426  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.93 
 
 		 674 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.22 
 
 		 674 aa  420  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.22 
 
 		 904 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.78 
 
 		 674 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.07 
 
 		 674 aa  419  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 		 925 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 687 aa  416  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.94 
 
 		 689 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 901 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 688 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.03 
 
 		 879 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.14 
 
 		 686 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.68 
 
 		 685 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.94 
 
 		 937 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.15 
 
 		 688 aa  405  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.76 
 
 		 963 aa  401  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.86 
 
 		 688 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.08 
 
 		 917 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.86 
 
 		 961 aa  398  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  35.69 
 
 		 716 aa  397  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.48 
 
 		 924 aa  396  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.42 
 
 		 957 aa  399  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.48 
 
 		 727 aa  394  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  35.81 
 
 		 734 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.32 
 
 		 893 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.26 
 
 		 688 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.97 
 
 		 686 aa  395  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.37 
 
 		 945 aa  394  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.72 
 
 		 898 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  35.91 
 
 		 757 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  38.1 
 
 		 1173 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  34.93 
 
 		 687 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.21 
 
 		 689 aa  391  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.58 
 
 		 721 aa  392  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  37.39 
 
 		 734 aa  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.56 
 
 		 963 aa  391  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.59 
 
 		 729 aa  389  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  33.43 
 
 		 1171 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.07 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.24 
 
 		 929 aa  389  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.06 
 
 		 927 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  35.89 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.22 
 
 		 724 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  38.07 
 
 		 906 aa  386  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 746 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.19 
 
 		 746 aa  386  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.85 
 
 		 1130 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 		 900 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.03 
 
 		 988 aa  382  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.44 
 
 		 676 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.44 
 
 		 676 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 		 942 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.39 
 
 		 1440 aa  382  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.32 
 
 		 754 aa  381  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.53 
 
 		 893 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 		 988 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.38 
 
 		 745 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 		 988 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.23 
 
 		 893 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.97 
 
 		 905 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  36.93 
 
 		 908 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.3 
 
 		 676 aa  379  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 1440 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  36.95 
 
 		 901 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.27 
 
 		 1421 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.89 
 
 		 904 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.25 
 
 		 900 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.77 
 
 		 1111 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  35.84 
 
 		 958 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.76 
 
 		 724 aa  376  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.58 
 
 		 989 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.41 
 
 		 933 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.91 
 
 		 668 aa  375  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>