More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2390 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 709 aa  1435    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  47.77 
 
 		 691 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  47.45 
 
 		 715 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  46.36 
 
 		 706 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  46.59 
 
 		 714 aa  537  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  46.58 
 
 		 835 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  44.89 
 
 		 708 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  43.23 
 
 		 715 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  46.06 
 
 		 862 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  45.27 
 
 		 761 aa  516  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  45.1 
 
 		 883 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  46.53 
 
 		 715 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  46.71 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 		 699 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 		 698 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  44.73 
 
 		 741 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 		 677 aa  493  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  42.88 
 
 		 704 aa  487  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  44.21 
 
 		 741 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 		 732 aa  483  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.39 
 
 		 766 aa  481  1e-134  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  41.87 
 
 		 733 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  43.11 
 
 		 738 aa  435  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.5 
 
 		 674 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.68 
 
 		 695 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.02 
 
 		 677 aa  396  1e-109  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 674 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.36 
 
 		 674 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.11 
 
 		 687 aa  376  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 686 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.25 
 
 		 917 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 		 685 aa  364  4e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.99 
 
 		 688 aa  362  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.23 
 
 		 898 aa  360  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  31.65 
 
 		 687 aa  353  7e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.44 
 
 		 688 aa  350  5e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.72 
 
 		 904 aa  350  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 		 676 aa  350  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.86 
 
 		 676 aa  347  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.9 
 
 		 689 aa  346  7e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.69 
 
 		 676 aa  346  1e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.58 
 
 		 688 aa  343  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.05 
 
 		 893 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.28 
 
 		 920 aa  341  2e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  33.8 
 
 		 745 aa  339  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.7 
 
 		 668 aa  339  9.999999999999999e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.52 
 
 		 900 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.5 
 
 		 900 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.35 
 
 		 1406 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.78 
 
 		 688 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.97 
 
 		 886 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.17 
 
 		 901 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.39 
 
 		 924 aa  336  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  35.38 
 
 		 1173 aa  334  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.7 
 
 		 879 aa  331  3e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 		 662 aa  331  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  32.4 
 
 		 734 aa  330  5.0000000000000004e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  32.37 
 
 		 746 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.37 
 
 		 906 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.55 
 
 		 893 aa  328  2.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.16 
 
 		 905 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.07 
 
 		 933 aa  326  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.86 
 
 		 925 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 746 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  35.31 
 
 		 901 aa  324  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.47 
 
 		 888 aa  323  7e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  33.38 
 
 		 906 aa  323  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.58 
 
 		 727 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.85 
 
 		 721 aa  321  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 		 994 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  35.19 
 
 		 906 aa  321  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.53 
 
 		 893 aa  321  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  33.43 
 
 		 908 aa  320  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  34.87 
 
 		 908 aa  320  5e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.51 
 
 		 899 aa  320  6e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 958 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2493  molybdopterin oxidoreductase  34.41 
 
 		 880 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.49 
 
 		 685 aa  319  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.87 
 
 		 689 aa  318  2e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.88 
 
 		 754 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  34.08 
 
 		 724 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.59 
 
 		 929 aa  317  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.24 
 
 		 944 aa  317  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 		 986 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.55 
 
 		 955 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.27 
 
 		 904 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.96 
 
 		 924 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.83 
 
 		 687 aa  313  9e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.33 
 
 		 686 aa  313  9e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 		 902 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.03 
 
 		 1440 aa  313  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 		 1171 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.48 
 
 		 983 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  30.48 
 
 		 757 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.31 
 
 		 956 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.66 
 
 		 718 aa  310  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.8 
 
 		 953 aa  310  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.24 
 
 		 983 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.86 
 
 		 983 aa  310  8e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>