More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1238 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 721 aa  1490    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  81.6 
 
 		 718 aa  1194    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.83 
 
 		 677 aa  587  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.49 
 
 		 676 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.49 
 
 		 676 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.55 
 
 		 686 aa  582  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.64 
 
 		 676 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.6 
 
 		 879 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.69 
 
 		 674 aa  571  1e-161  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.98 
 
 		 687 aa  568  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.84 
 
 		 674 aa  567  1e-160  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.4 
 
 		 674 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  43.7 
 
 		 695 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.96 
 
 		 674 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.35 
 
 		 904 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.63 
 
 		 893 aa  551  1e-155  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.42 
 
 		 886 aa  542  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.45 
 
 		 688 aa  543  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.82 
 
 		 689 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.83 
 
 		 688 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.41 
 
 		 917 aa  538  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.01 
 
 		 893 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.07 
 
 		 688 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.57 
 
 		 689 aa  531  1e-149  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  42.08 
 
 		 687 aa  526  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.78 
 
 		 893 aa  527  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.16 
 
 		 900 aa  523  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.97 
 
 		 945 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.43 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.99 
 
 		 920 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.72 
 
 		 685 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.71 
 
 		 900 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 937 aa  509  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 1410 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  41.98 
 
 		 899 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.23 
 
 		 901 aa  506  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.64 
 
 		 925 aa  503  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.46 
 
 		 686 aa  505  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.22 
 
 		 953 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.45 
 
 		 898 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.87 
 
 		 1130 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  39.47 
 
 		 745 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.95 
 
 		 754 aa  497  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.94 
 
 		 929 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.94 
 
 		 988 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  40.17 
 
 		 1412 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.64 
 
 		 1111 aa  492  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.57 
 
 		 1406 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.5 
 
 		 933 aa  493  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.5 
 
 		 1421 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.57 
 
 		 1385 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.87 
 
 		 1440 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.31 
 
 		 988 aa  489  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 		 685 aa  491  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.35 
 
 		 924 aa  491  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 662 aa  490  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.69 
 
 		 957 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.96 
 
 		 924 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 		 1425 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.3 
 
 		 1425 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 		 988 aa  487  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 		 1440 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.3 
 
 		 927 aa  487  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.78 
 
 		 1425 aa  485  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  39.35 
 
 		 1387 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.29 
 
 		 1428 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.32 
 
 		 949 aa  480  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.83 
 
 		 963 aa  479  1e-134  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 989 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.54 
 
 		 1432 aa  482  1e-134  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.41 
 
 		 989 aa  482  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 989 aa  481  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.01 
 
 		 989 aa  479  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.54 
 
 		 1432 aa  482  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 		 961 aa  478  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 		 1110 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.67 
 
 		 955 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.4 
 
 		 1432 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.47 
 
 		 963 aa  478  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.13 
 
 		 668 aa  476  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.91 
 
 		 906 aa  475  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.39 
 
 		 1424 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.03 
 
 		 687 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 		 942 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.48 
 
 		 911 aa  460  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.18 
 
 		 905 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 		 903 aa  460  9.999999999999999e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 718 aa  459  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  37.73 
 
 		 716 aa  459  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.5 
 
 		 909 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 		 952 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  37.93 
 
 		 713 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.71 
 
 		 956 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.48 
 
 		 950 aa  449  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  37.79 
 
 		 957 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 		 979 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 		 984 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.24 
 
 		 982 aa  449  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.11 
 
 		 984 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>