More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1925 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
986 aa  2061    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.19 
 
 
979 aa  1122    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.1 
 
 
973 aa  1083    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.91 
 
 
978 aa  1226    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.43 
 
 
1012 aa  1271    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.7 
 
 
978 aa  1227    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.7 
 
 
978 aa  1227    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.54 
 
 
979 aa  1272    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  58.7 
 
 
978 aa  1227    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.64 
 
 
979 aa  1274    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  58.6 
 
 
978 aa  1227    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.23 
 
 
979 aa  1268    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.64 
 
 
979 aa  1274    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.33 
 
 
898 aa  639    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.42 
 
 
984 aa  1195    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.7 
 
 
978 aa  1227    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.54 
 
 
979 aa  1272    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.91 
 
 
978 aa  1233    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  38.31 
 
 
899 aa  645    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.83 
 
 
917 aa  660    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.47 
 
 
985 aa  1188    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.04 
 
 
987 aa  1325    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.22 
 
 
980 aa  1246    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.82 
 
 
893 aa  635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.25 
 
 
1004 aa  1283    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.43 
 
 
1111 aa  655    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.23 
 
 
979 aa  1267    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.43 
 
 
979 aa  1273    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 
893 aa  647    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  59.11 
 
 
978 aa  1235    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.44 
 
 
987 aa  1313    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  58.6 
 
 
978 aa  1224    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  71.18 
 
 
994 aa  1500    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  60.12 
 
 
979 aa  1269    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.42 
 
 
984 aa  1195    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.09 
 
 
1110 aa  651    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.81 
 
 
980 aa  1225    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.97 
 
 
879 aa  632  1e-180  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.62 
 
 
893 aa  624  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.69 
 
 
901 aa  616  1e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.93 
 
 
900 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.77 
 
 
900 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.66 
 
 
886 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.46 
 
 
904 aa  602  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.98 
 
 
983 aa  592  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.57 
 
 
983 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.57 
 
 
983 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.15 
 
 
983 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 
983 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 
983 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 
983 aa  581  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
984 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 
960 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 
982 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.09 
 
 
979 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.31 
 
 
967 aa  569  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.93 
 
 
944 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.57 
 
 
960 aa  572  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 
982 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  35.48 
 
 
957 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.09 
 
 
920 aa  570  1e-161  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.31 
 
 
948 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 
947 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 
960 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.64 
 
 
984 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.75 
 
 
905 aa  568  1e-160  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.89 
 
 
959 aa  568  1e-160  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.45 
 
 
959 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.35 
 
 
933 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 
960 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 
959 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.02 
 
 
937 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.25 
 
 
960 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.35 
 
 
960 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 
988 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.36 
 
 
966 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 
956 aa  561  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.22 
 
 
952 aa  561  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 
988 aa  560  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.77 
 
 
949 aa  561  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.17 
 
 
945 aa  561  1e-158  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.2 
 
 
929 aa  560  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.33 
 
 
925 aa  557  1e-157  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.2 
 
 
959 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 
1000 aa  557  1e-157  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 
957 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 
989 aa  558  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.81 
 
 
969 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.91 
 
 
978 aa  558  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 
988 aa  554  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.38 
 
 
989 aa  556  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 
948 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.19 
 
 
973 aa  555  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.21 
 
 
948 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>