More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2376 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.05 
 
 
979 aa  1157    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.85 
 
 
979 aa  1064    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
984 aa  2068    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.51 
 
 
994 aa  1196    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.59 
 
 
978 aa  1136    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.05 
 
 
1012 aa  1157    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.39 
 
 
978 aa  1136    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.56 
 
 
979 aa  1166    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  55.39 
 
 
978 aa  1135    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.46 
 
 
979 aa  1162    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  55.28 
 
 
978 aa  1135    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.05 
 
 
979 aa  1155    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.26 
 
 
973 aa  1057    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.39 
 
 
978 aa  1136    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.56 
 
 
979 aa  1166    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.05 
 
 
980 aa  1153    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  56.46 
 
 
979 aa  1163    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.42 
 
 
986 aa  1195    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.7 
 
 
985 aa  1054    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.16 
 
 
987 aa  1186    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.39 
 
 
978 aa  1136    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.77 
 
 
1004 aa  1210    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.75 
 
 
979 aa  1150    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.85 
 
 
979 aa  1155    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.73 
 
 
987 aa  1190    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.49 
 
 
978 aa  1137    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.48 
 
 
980 aa  1132    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.39 
 
 
978 aa  1133    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  55.49 
 
 
978 aa  1137    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 
984 aa  2068    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.83 
 
 
1110 aa  626  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.89 
 
 
893 aa  628  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.06 
 
 
917 aa  624  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.85 
 
 
898 aa  616  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.37 
 
 
893 aa  610  1e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.49 
 
 
879 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.93 
 
 
893 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.58 
 
 
886 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
904 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.03 
 
 
1111 aa  566  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.18 
 
 
900 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.92 
 
 
900 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.39 
 
 
899 aa  567  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1473  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.41 
 
 
947 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0442327  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.24 
 
 
754 aa  553  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 
959 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 
960 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.52 
 
 
960 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.96 
 
 
967 aa  550  1e-155  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.72 
 
 
906 aa  551  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 
960 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0839  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.64 
 
 
946 aa  548  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.331727  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.93 
 
 
952 aa  548  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.37 
 
 
983 aa  546  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 
983 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.23 
 
 
901 aa  542  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.4 
 
 
948 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.37 
 
 
948 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.94 
 
 
959 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.79 
 
 
966 aa  537  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 
956 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 
983 aa  538  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.12 
 
 
984 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  33.64 
 
 
957 aa  538  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.09 
 
 
979 aa  538  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.26 
 
 
983 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.13 
 
 
957 aa  534  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 
984 aa  536  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 
984 aa  536  1e-150  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.36 
 
 
984 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  33.68 
 
 
960 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.98 
 
 
983 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 
984 aa  536  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  33.44 
 
 
982 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.98 
 
 
983 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.68 
 
 
960 aa  534  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 
984 aa  536  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.98 
 
 
983 aa  535  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.82 
 
 
920 aa  533  1e-150  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.36 
 
 
984 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  32.99 
 
 
977 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.44 
 
 
982 aa  531  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2558  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.34 
 
 
973 aa  530  1e-149  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.779669  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.36 
 
 
984 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 
948 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.48 
 
 
959 aa  532  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.8 
 
 
959 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.02 
 
 
1000 aa  529  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.54 
 
 
969 aa  527  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.05 
 
 
949 aa  529  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.16 
 
 
959 aa  528  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 
948 aa  527  1e-148  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.78 
 
 
959 aa  525  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.51 
 
 
978 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.78 
 
 
944 aa  526  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.64 
 
 
952 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.85 
 
 
948 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.22 
 
 
988 aa  519  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2853  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.06 
 
 
960 aa  522  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.771386 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2856  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.85 
 
 
959 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>