More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1318 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A3598  molybdopterin oxidoreductase family protein  50.72 
 
 		 979 aa  1034    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  82.15 
 
 		 979 aa  1711    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.07 
 
 		 901 aa  645    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2376  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.26 
 
 		 984 aa  1057    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.35 
 
 		 978 aa  1074    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  51.94 
 
 		 978 aa  1064    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3588  molybdopterin oxidoreductase family protein  50.72 
 
 		 1012 aa  1038    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.15 
 
 		 978 aa  1070    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3367  molybdopterin oxidoreductase family protein  50.72 
 
 		 979 aa  1033    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  52.15 
 
 		 978 aa  1071    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3331  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.82 
 
 		 979 aa  1035    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.291632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  52.25 
 
 		 978 aa  1072    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.61 
 
 		 979 aa  1030    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.93 
 
 		 879 aa  645    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.04 
 
 		 978 aa  1068    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3681  molybdopterin oxidoreductase family protein  51.02 
 
 		 979 aa  1035    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.725199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2333  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.26 
 
 		 984 aa  1057    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.15 
 
 		 978 aa  1070    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3631  molybdopterin oxidoreductase family protein  50.72 
 
 		 979 aa  1033    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.461158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0502  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.1 
 
 		 980 aa  1067    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.25 
 
 		 978 aa  1072    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.17 
 
 		 987 aa  1116    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.52 
 
 		 893 aa  649    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.88 
 
 		 1004 aa  1072    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.83 
 
 		 898 aa  665    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.25 
 
 		 987 aa  1098    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.58 
 
 		 917 aa  665    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1636  molybdopterin oxidoreductase family protein  50.82 
 
 		 979 aa  1031    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.632493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.31 
 
 		 985 aa  971    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.9 
 
 		 994 aa  1100    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.56 
 
 		 980 aa  1071    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  52.15 
 
 		 978 aa  1070    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.1 
 
 		 986 aa  1083    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3581  molybdopterin oxidoreductase family protein  50.82 
 
 		 979 aa  1036    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 973 aa  2016    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.37 
 
 		 893 aa  634  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.61 
 
 		 893 aa  628  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.7 
 
 		 900 aa  622  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.08 
 
 		 904 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.25 
 
 		 886 aa  615  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  37.86 
 
 		 899 aa  614  9.999999999999999e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.03 
 
 		 900 aa  609  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 983 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 		 983 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.9 
 
 		 983 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 		 983 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.9 
 
 		 983 aa  587  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 		 983 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.12 
 
 		 983 aa  581  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 		 984 aa  579  1e-164  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0450  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.858013  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  34.8 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.02 
 
 		 979 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.41 
 
 		 982 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.8 
 
 		 984 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.89 
 
 		 905 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.7 
 
 		 984 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.4 
 
 		 982 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  35.21 
 
 		 957 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.97 
 
 		 956 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.52 
 
 		 1110 aa  567  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 		 960 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 		 947 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.15 
 
 		 959 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 		 960 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.53 
 
 		 960 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.68 
 
 		 967 aa  561  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.38 
 
 		 944 aa  560  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.2 
 
 		 969 aa  559  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1861  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.17 
 
 		 978 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3019  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 		 957 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.73 
 
 		 906 aa  554  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.66 
 
 		 1000 aa  554  1e-156  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3656  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.63 
 
 		 948 aa  551  1e-155  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.480327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  33.75 
 
 		 977 aa  547  1e-154  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.52 
 
 		 952 aa  549  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.17 
 
 		 1406 aa  548  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4998  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.1 
 
 		 953 aa  543  1e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217845  hitchhiker  0.000835215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.24 
 
 		 959 aa  544  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2383  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.02 
 
 		 959 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.16 
 
 		 945 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.02 
 
 		 754 aa  544  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.41 
 
 		 950 aa  544  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.02 
 
 		 951 aa  540  9.999999999999999e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1080  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  34.37 
 
 		 960 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.86 
 
 		 948 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.47 
 
 		 948 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.3 
 
 		 949 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.31 
 
 		 950 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4914  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.93 
 
 		 950 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.263268 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4024  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.61 
 
 		 966 aa  536  1e-151  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.37 
 
 		 1428 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2741  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.27 
 
 		 960 aa  539  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.313061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  37.51 
 
 		 1387 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0735  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.51 
 
 		 952 aa  536  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.32 
 
 		 1111 aa  539  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.8 
 
 		 959 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>