More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0685 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  82.02 
 
 		 721 aa  1213    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 718 aa  1481    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.34 
 
 		 677 aa  585  1e-166  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.59 
 
 		 676 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.27 
 
 		 686 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.21 
 
 		 674 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.77 
 
 		 674 aa  580  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.3 
 
 		 676 aa  580  1e-164  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.06 
 
 		 674 aa  578  1e-164  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.49 
 
 		 674 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.01 
 
 		 676 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.59 
 
 		 879 aa  575  1.0000000000000001e-162  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.43 
 
 		 687 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.34 
 
 		 689 aa  555  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.01 
 
 		 688 aa  553  1e-156  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.1 
 
 		 893 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  42.76 
 
 		 695 aa  550  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.95 
 
 		 893 aa  546  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.58 
 
 		 886 aa  547  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.27 
 
 		 904 aa  546  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.14 
 
 		 688 aa  542  1e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.23 
 
 		 917 aa  543  1e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.25 
 
 		 688 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.35 
 
 		 900 aa  538  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 		 893 aa  532  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.11 
 
 		 689 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.81 
 
 		 900 aa  529  1e-149  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.05 
 
 		 686 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  42.02 
 
 		 687 aa  529  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.42 
 
 		 945 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.77 
 
 		 925 aa  523  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.4 
 
 		 685 aa  523  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.23 
 
 		 688 aa  522  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.58 
 
 		 685 aa  525  1e-147  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.67 
 
 		 933 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  41.86 
 
 		 899 aa  514  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.29 
 
 		 898 aa  515  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 		 920 aa  510  1e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.6 
 
 		 906 aa  506  9.999999999999999e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.88 
 
 		 1130 aa  508  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 937 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.07 
 
 		 988 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.3 
 
 		 988 aa  509  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.11 
 
 		 1410 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.93 
 
 		 988 aa  504  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.86 
 
 		 953 aa  500  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 901 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  38.8 
 
 		 745 aa  495  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  40.36 
 
 		 1385 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.81 
 
 		 662 aa  496  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 		 963 aa  496  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 989 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.61 
 
 		 1440 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 989 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.72 
 
 		 989 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.71 
 
 		 668 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 1440 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.58 
 
 		 989 aa  489  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.22 
 
 		 1406 aa  489  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.75 
 
 		 924 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  39.2 
 
 		 1412 aa  491  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.52 
 
 		 1110 aa  491  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  39.24 
 
 		 1387 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.81 
 
 		 1111 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.25 
 
 		 924 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.95 
 
 		 927 aa  486  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.7 
 
 		 911 aa  483  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.5 
 
 		 949 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.69 
 
 		 929 aa  482  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 905 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.69 
 
 		 961 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 1421 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.07 
 
 		 724 aa  478  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.67 
 
 		 963 aa  477  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.78 
 
 		 1428 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.66 
 
 		 1425 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.22 
 
 		 1425 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.8 
 
 		 903 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.14 
 
 		 754 aa  475  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.28 
 
 		 957 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.72 
 
 		 955 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 1425 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 		 1424 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 1432 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 1432 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 		 1432 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 956 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  37.76 
 
 		 957 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.86 
 
 		 983 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3269  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 		 942 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.964291  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  38.42 
 
 		 909 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  36.75 
 
 		 715 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  36.75 
 
 		 715 aa  456  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  37.11 
 
 		 716 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.75 
 
 		 715 aa  457  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  36.75 
 
 		 715 aa  457  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.9 
 
 		 687 aa  457  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.75 
 
 		 715 aa  457  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.29 
 
 		 950 aa  456  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  37.8 
 
 		 982 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>