More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2361 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  51.09 
 
 		 862 aa  651    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  55.31 
 
 		 738 aa  731    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  55.02 
 
 		 835 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  50.07 
 
 		 741 aa  665    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  55.22 
 
 		 691 aa  743    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  65.2 
 
 		 715 aa  909    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 732 aa  1476    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  55.77 
 
 		 699 aa  698    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.18 
 
 		 761 aa  724    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  55.24 
 
 		 715 aa  737    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  54.41 
 
 		 714 aa  728    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  52.6 
 
 		 883 aa  682    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  54.82 
 
 		 698 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  55.91 
 
 		 706 aa  765    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  56.07 
 
 		 677 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  65.08 
 
 		 741 aa  884    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  54.69 
 
 		 733 aa  736    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  51.03 
 
 		 708 aa  694    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  48.7 
 
 		 704 aa  649    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  55.25 
 
 		 680 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.23 
 
 		 766 aa  547  1e-154  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  42.6 
 
 		 715 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  43.13 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.87 
 
 		 674 aa  399  1e-109  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 674 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.7 
 
 		 674 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.25 
 
 		 906 aa  395  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.21 
 
 		 904 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.15 
 
 		 674 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.65 
 
 		 917 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.01 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.01 
 
 		 676 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.86 
 
 		 677 aa  380  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 676 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.16 
 
 		 1110 aa  376  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 		 900 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.21 
 
 		 886 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.69 
 
 		 925 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.61 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.06 
 
 		 879 aa  372  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.28 
 
 		 901 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.78 
 
 		 729 aa  369  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.69 
 
 		 688 aa  368  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.61 
 
 		 905 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.69 
 
 		 933 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.69 
 
 		 685 aa  368  1e-100  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  31.63 
 
 		 1171 aa  364  3e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.65 
 
 		 911 aa  364  3e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.71 
 
 		 668 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  33.88 
 
 		 899 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.88 
 
 		 687 aa  360  5e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.78 
 
 		 988 aa  360  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.78 
 
 		 988 aa  360  7e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.06 
 
 		 989 aa  359  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.39 
 
 		 945 aa  359  9.999999999999999e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 988 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.15 
 
 		 1111 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.28 
 
 		 695 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.66 
 
 		 898 aa  357  5.999999999999999e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.93 
 
 		 924 aa  356  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.33 
 
 		 989 aa  355  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.65 
 
 		 989 aa  353  5e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.84 
 
 		 953 aa  353  8e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.06 
 
 		 920 aa  353  8.999999999999999e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.64 
 
 		 924 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 		 716 aa  352  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.51 
 
 		 989 aa  352  2e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.79 
 
 		 688 aa  352  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.81 
 
 		 955 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.16 
 
 		 662 aa  350  5e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3660  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.12 
 
 		 888 aa  349  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  35.4 
 
 		 1173 aa  349  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  35.3 
 
 		 909 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.04 
 
 		 893 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.83 
 
 		 754 aa  346  7e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.94 
 
 		 688 aa  346  7e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 724 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.12 
 
 		 937 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  33.24 
 
 		 908 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.34 
 
 		 893 aa  343  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.27 
 
 		 963 aa  343  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2823  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.01 
 
 		 949 aa  343  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.156592  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.91 
 
 		 689 aa  343  8e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  31.49 
 
 		 734 aa  343  9e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.19 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.98 
 
 		 686 aa  342  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.38 
 
 		 724 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.88 
 
 		 985 aa  342  2e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.28 
 
 		 1130 aa  342  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  32.58 
 
 		 745 aa  342  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.03 
 
 		 929 aa  341  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  33.06 
 
 		 906 aa  340  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.55 
 
 		 900 aa  340  7e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  33.69 
 
 		 746 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  33.69 
 
 		 746 aa  339  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.75 
 
 		 721 aa  337  5e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  34.26 
 
 		 906 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.77 
 
 		 893 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.09 
 
 		 685 aa  335  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.94 
 
 		 727 aa  335  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>