More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3867 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  65.11 
 
 		 706 aa  872    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  61.49 
 
 		 883 aa  793    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0398  molybdopterin oxidoreductase  60.22 
 
 		 862 aa  776    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 715 aa  1419    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  59.95 
 
 		 741 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5926  molybdopterin oxidoreductase  65.86 
 
 		 691 aa  880    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1821  molybdopterin oxidoreductase  58.12 
 
 		 741 aa  732    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  62.4 
 
 		 715 aa  799    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  63.14 
 
 		 761 aa  875    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2244  molybdopterin oxidoreductase  60.54 
 
 		 835 aa  783    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.447285  normal  0.921871 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0835  molybdopterin oxidoreductase  61.84 
 
 		 677 aa  794    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  58.24 
 
 		 708 aa  792    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6177  molybdopterin oxidoreductase  59.12 
 
 		 699 aa  745    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2361  molybdopterin oxidoreductase  55.24 
 
 		 732 aa  729    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.113939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1267  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  53.64 
 
 		 733 aa  682    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2167  molybdopterin oxidoreductase  59.37 
 
 		 698 aa  737    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.678571  normal  0.0125903 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  89.65 
 
 		 714 aa  1254    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1312  molybdopterin oxidoreductase  54.48 
 
 		 738 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000067691 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.58 
 
 		 766 aa  668    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  56.92 
 
 		 704 aa  757    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  61.99 
 
 		 680 aa  793    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  48.29 
 
 		 715 aa  611  1e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  47.45 
 
 		 709 aa  552  1e-156  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.3 
 
 		 674 aa  449  1e-125  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.17 
 
 		 674 aa  451  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.73 
 
 		 674 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.02 
 
 		 674 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.09 
 
 		 687 aa  435  1e-120  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.34 
 
 		 689 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.1 
 
 		 695 aa  426  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.39 
 
 		 688 aa  428  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  37.02 
 
 		 716 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.96 
 
 		 677 aa  423  1e-117  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  34.96 
 
 		 687 aa  422  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.24 
 
 		 686 aa  421  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 		 688 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.47 
 
 		 886 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 688 aa  416  1e-114  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.59 
 
 		 676 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 		 688 aa  409  1e-113  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.02 
 
 		 727 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.73 
 
 		 729 aa  409  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.3 
 
 		 676 aa  411  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.21 
 
 		 904 aa  412  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.16 
 
 		 676 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.49 
 
 		 685 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.67 
 
 		 689 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  34.18 
 
 		 1171 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.24 
 
 		 734 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  34.18 
 
 		 734 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.62 
 
 		 917 aa  392  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  36.9 
 
 		 744 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.76 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  35.73 
 
 		 899 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 893 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.28 
 
 		 901 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 		 879 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 686 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 		 718 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  37.74 
 
 		 1173 aa  391  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 		 925 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 		 911 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 		 900 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  34.18 
 
 		 734 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.61 
 
 		 924 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 		 1180 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.57 
 
 		 906 aa  381  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  37.41 
 
 		 1396 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  35.7 
 
 		 724 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.2 
 
 		 721 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.14 
 
 		 662 aa  377  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 		 746 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.53 
 
 		 754 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  36.3 
 
 		 908 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.15 
 
 		 937 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.9 
 
 		 951 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 757 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  34.33 
 
 		 746 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  37.57 
 
 		 906 aa  372  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.39 
 
 		 909 aa  372  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.62 
 
 		 727 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.02 
 
 		 961 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  33 
 
 		 1176 aa  371  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.06 
 
 		 668 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.08 
 
 		 986 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.02 
 
 		 963 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  33 
 
 		 933 aa  367  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  35.76 
 
 		 906 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  39.75 
 
 		 1394 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.34 
 
 		 955 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  37.59 
 
 		 901 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.15 
 
 		 905 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  32.89 
 
 		 1228 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  37.41 
 
 		 908 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  35.59 
 
 		 1338 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  34.87 
 
 		 788 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.16 
 
 		 951 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.3 
 
 		 951 aa  366  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.74 
 
 		 743 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.16 
 
 		 951 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>