More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0131 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_09037  periplasmic nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15190)  57.8 
 
 		 1009 aa  956    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  63.71 
 
 		 834 aa  1014    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4538  molybdopterin oxidoreductase  56.68 
 
 		 830 aa  918    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104791  normal  0.555476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  66.88 
 
 		 964 aa  1093    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 788 aa  1640    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  62.6 
 
 		 779 aa  1005    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  60.49 
 
 		 818 aa  964    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  57.14 
 
 		 776 aa  899    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2122  molybdopterin oxidoreductase  46.21 
 
 		 814 aa  633  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.890229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  41.34 
 
 		 744 aa  558  1e-157  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  39.68 
 
 		 762 aa  480  1e-134  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  37.83 
 
 		 724 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  36.01 
 
 		 757 aa  442  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  36.35 
 
 		 716 aa  442  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  34.81 
 
 		 734 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  36.82 
 
 		 906 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  36.39 
 
 		 931 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  34.42 
 
 		 734 aa  439  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  36.16 
 
 		 908 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  36.44 
 
 		 906 aa  435  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  36.16 
 
 		 746 aa  429  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.39 
 
 		 727 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.66 
 
 		 929 aa  429  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.96 
 
 		 734 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.2 
 
 		 688 aa  426  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.45 
 
 		 727 aa  422  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  35.69 
 
 		 908 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.58 
 
 		 729 aa  421  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  35.89 
 
 		 746 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  36.46 
 
 		 954 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  37.4 
 
 		 1232 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.56 
 
 		 905 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  36.6 
 
 		 752 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  35.67 
 
 		 901 aa  421  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.75 
 
 		 894 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.66 
 
 		 904 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.38 
 
 		 951 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  35.66 
 
 		 758 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  36.04 
 
 		 958 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  36.85 
 
 		 752 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.32 
 
 		 986 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  35.48 
 
 		 955 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.18 
 
 		 907 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.51 
 
 		 951 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.51 
 
 		 951 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  35.85 
 
 		 952 aa  412  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.78 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  36.19 
 
 		 752 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.79 
 
 		 766 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.51 
 
 		 951 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.24 
 
 		 951 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.38 
 
 		 951 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.31 
 
 		 1003 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 893 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.24 
 
 		 951 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.38 
 
 		 951 aa  412  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.15 
 
 		 686 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.75 
 
 		 677 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.14 
 
 		 952 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  35.27 
 
 		 953 aa  408  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  37.18 
 
 		 1396 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.93 
 
 		 745 aa  402  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 		 674 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.84 
 
 		 674 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  34.99 
 
 		 1312 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.65 
 
 		 674 aa  399  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 		 674 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.02 
 
 		 695 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.56 
 
 		 1395 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.28 
 
 		 688 aa  396  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  36.24 
 
 		 1313 aa  397  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  35.33 
 
 		 1395 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  33.79 
 
 		 1176 aa  399  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  35.31 
 
 		 1397 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  35.33 
 
 		 1395 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  34.31 
 
 		 755 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  35.44 
 
 		 1397 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.27 
 
 		 917 aa  397  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.33 
 
 		 1338 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  35.33 
 
 		 1395 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  33.42 
 
 		 1171 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.56 
 
 		 899 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.65 
 
 		 685 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.74 
 
 		 688 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.55 
 
 		 689 aa  395  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  36.09 
 
 		 1342 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  35.52 
 
 		 1384 aa  390  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  33.51 
 
 		 687 aa  392  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  34.03 
 
 		 1383 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  34.46 
 
 		 1405 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  34.77 
 
 		 946 aa  392  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  35.62 
 
 		 1173 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.65 
 
 		 689 aa  389  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 1180 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.61 
 
 		 900 aa  389  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.47 
 
 		 900 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  34.7 
 
 		 1357 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  35.2 
 
 		 1409 aa  383  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  34.12 
 
 		 1317 aa  383  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  34.21 
 
 		 770 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>