More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2122 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  51.68 
 
 		 834 aa  746    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  50 
 
 		 964 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  49.82 
 
 		 818 aa  716    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2122  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 814 aa  1603    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.890229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  49.75 
 
 		 779 aa  735    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4538  molybdopterin oxidoreductase  50.19 
 
 		 830 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104791  normal  0.555476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  45.82 
 
 		 788 aa  647    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  49.19 
 
 		 776 aa  689    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09037  periplasmic nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15190)  42.26 
 
 		 1009 aa  590  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  35.37 
 
 		 744 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  35.19 
 
 		 762 aa  342  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  33.66 
 
 		 906 aa  326  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  33.84 
 
 		 908 aa  323  8e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  34.6 
 
 		 906 aa  320  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  34.04 
 
 		 908 aa  313  5.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  33.19 
 
 		 746 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.98 
 
 		 905 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  34.54 
 
 		 901 aa  302  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  34.53 
 
 		 1173 aa  301  4e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 746 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.15 
 
 		 929 aa  300  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.06 
 
 		 904 aa  298  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.19 
 
 		 907 aa  295  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  30.37 
 
 		 1176 aa  293  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 		 758 aa  293  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  31.01 
 
 		 734 aa  293  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 		 724 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  33.2 
 
 		 954 aa  291  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  32.8 
 
 		 752 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.72 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  32.67 
 
 		 752 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  32.93 
 
 		 752 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  31.42 
 
 		 757 aa  286  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 		 759 aa  284  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  32.03 
 
 		 741 aa  282  1e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  30.7 
 
 		 734 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  31.33 
 
 		 931 aa  282  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  33.99 
 
 		 951 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.99 
 
 		 951 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.13 
 
 		 951 aa  281  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  33.99 
 
 		 951 aa  281  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 		 958 aa  280  6e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.85 
 
 		 951 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.58 
 
 		 727 aa  279  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.85 
 
 		 951 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  29.95 
 
 		 727 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.11 
 
 		 986 aa  278  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.71 
 
 		 951 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.71 
 
 		 951 aa  278  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  30.65 
 
 		 946 aa  278  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.92 
 
 		 894 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.23 
 
 		 743 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.5 
 
 		 893 aa  275  3e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  31.58 
 
 		 729 aa  275  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.02 
 
 		 766 aa  273  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 952 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  31.16 
 
 		 1338 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  30.51 
 
 		 745 aa  270  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  30.89 
 
 		 933 aa  270  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  31.1 
 
 		 952 aa  269  1e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  29.93 
 
 		 743 aa  268  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 		 955 aa  267  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 		 716 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  29.49 
 
 		 1180 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  29.5 
 
 		 755 aa  264  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.03 
 
 		 899 aa  263  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.89 
 
 		 677 aa  262  2e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 		 1395 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 		 1395 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  32.4 
 
 		 1312 aa  261  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.76 
 
 		 879 aa  259  1e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 		 658 aa  259  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 		 953 aa  259  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 		 1405 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 		 1397 aa  258  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  33.38 
 
 		 1232 aa  257  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 		 1397 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 		 1395 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  31.65 
 
 		 1341 aa  256  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  34.09 
 
 		 1394 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  31.38 
 
 		 1357 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.99 
 
 		 1003 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.86 
 
 		 674 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  34.72 
 
 		 706 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.19 
 
 		 688 aa  253  1e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 1171 aa  252  2e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  32.24 
 
 		 1395 aa  252  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.75 
 
 		 686 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.67 
 
 		 674 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  33.09 
 
 		 1396 aa  250  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.3 
 
 		 904 aa  249  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 		 1228 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.67 
 
 		 674 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0882  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  33.33 
 
 		 640 aa  248  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.6443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  28.8 
 
 		 1188 aa  248  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  30.32 
 
 		 695 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.67 
 
 		 674 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  33.06 
 
 		 933 aa  247  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 		 1313 aa  247  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  31.46 
 
 		 1409 aa  246  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>