More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0053 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
658 aa  1365    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  39.54 
 
 
1173 aa  537  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  39.09 
 
 
727 aa  529  1e-149  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  40.74 
 
 
729 aa  529  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  41.03 
 
 
906 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  39.34 
 
 
724 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  40.52 
 
 
908 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  39 
 
 
746 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  40.43 
 
 
905 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  39 
 
 
746 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  40.14 
 
 
1176 aa  512  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.24 
 
 
743 aa  511  1e-143  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  39.19 
 
 
958 aa  511  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  38.13 
 
 
757 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  40.06 
 
 
908 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  39.89 
 
 
906 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  39.32 
 
 
743 aa  503  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  38.84 
 
 
931 aa  505  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  40.34 
 
 
1171 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.61 
 
 
951 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.61 
 
 
951 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.61 
 
 
951 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  39.89 
 
 
904 aa  496  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.47 
 
 
951 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  39.66 
 
 
901 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.61 
 
 
951 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  36.24 
 
 
953 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.61 
 
 
951 aa  497  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.47 
 
 
951 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.47 
 
 
951 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  38.41 
 
 
946 aa  492  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  39.37 
 
 
1188 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  38.16 
 
 
734 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  38.24 
 
 
1180 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.37 
 
 
907 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  39.3 
 
 
1403 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  39.02 
 
 
955 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.29 
 
 
952 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  37.27 
 
 
1397 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  36.97 
 
 
954 aa  486  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.53 
 
 
1003 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  37.15 
 
 
952 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  36.81 
 
 
1395 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  38.53 
 
 
1394 aa  483  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  37.61 
 
 
716 aa  485  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  37.27 
 
 
1395 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  37.41 
 
 
1395 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  37.27 
 
 
1397 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  37.41 
 
 
1395 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  38.2 
 
 
1405 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2212  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  38.17 
 
 
1401 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022132  normal  0.0161111 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  36.3 
 
 
1405 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  37.45 
 
 
1342 aa  477  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  38.63 
 
 
1409 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  38.49 
 
 
894 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  38.75 
 
 
933 aa  478  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  38.91 
 
 
1407 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  38.21 
 
 
933 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.33 
 
 
986 aa  478  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.85 
 
 
929 aa  473  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  37.99 
 
 
1383 aa  473  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  37.09 
 
 
1400 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  36.86 
 
 
1341 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  37.09 
 
 
1427 aa  462  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1395  molybdopterin oxidoreductase  36.24 
 
 
1384 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.427794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  36.81 
 
 
1396 aa  463  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  36.31 
 
 
1338 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  37.09 
 
 
1418 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  36.58 
 
 
1357 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  37.09 
 
 
1418 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1159  molybdopterin oxidoreductase  36.21 
 
 
907 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  37.09 
 
 
1418 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  37.62 
 
 
896 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  37.37 
 
 
884 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3229  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.9 
 
 
1271 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00976953  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3240  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.9 
 
 
1271 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.476034  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  37.09 
 
 
1418 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3291  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  35.9 
 
 
1271 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.362066 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  37.09 
 
 
1418 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  36.95 
 
 
1418 aa  459  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  37.09 
 
 
1398 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  35.57 
 
 
1317 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  37.32 
 
 
1257 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  35.43 
 
 
1312 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  36.93 
 
 
1232 aa  453  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3045  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.44 
 
 
873 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0250734  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  37.37 
 
 
1313 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  37.99 
 
 
897 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.08 
 
 
874 aa  451  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  35.2 
 
 
967 aa  451  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0590  nitrate reductase  37.32 
 
 
879 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.18 
 
 
906 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.85 
 
 
915 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  37.23 
 
 
1370 aa  445  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2954  molybdopterin oxidoreductase  37.22 
 
 
901 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4167  Nitrate reductase  34.36 
 
 
915 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4279  Nitrate reductase  34.36 
 
 
915 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.49754 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2813  molybdopterin oxidoreductase  35.79 
 
 
899 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4821  assimilatory nitrate reductase (NADH) large subunit  36.16 
 
 
915 aa  441  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0576788  normal  0.823575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  42.13 
 
 
1228 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>