More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4046 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001307  ANIA_09037  periplasmic nitrate reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15190)  55.95 
 
 
1009 aa  913    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4538  molybdopterin oxidoreductase  59.69 
 
 
830 aa  949    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.104791  normal  0.555476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  62.6 
 
 
788 aa  993    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4662  molybdopterin oxidoreductase  64.86 
 
 
818 aa  1023    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.690498  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  63.29 
 
 
964 aa  1008    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19050  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  69.27 
 
 
834 aa  1120    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163662  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2122  molybdopterin oxidoreductase  49.75 
 
 
814 aa  711    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.890229  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
779 aa  1610    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  65.12 
 
 
776 aa  1043    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  41.39 
 
 
744 aa  545  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  38.02 
 
 
762 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2353  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  36.42 
 
 
727 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.895801  normal  0.416805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  36.27 
 
 
906 aa  446  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  34.79 
 
 
734 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  35.19 
 
 
734 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.32 
 
 
905 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  36.49 
 
 
908 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  36.1 
 
 
908 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  35.76 
 
 
758 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2463  molybdopterin oxidoreductase  35.35 
 
 
746 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  35.86 
 
 
906 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.88 
 
 
907 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  35.5 
 
 
954 aa  427  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  34.24 
 
 
931 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  35.6 
 
 
901 aa  425  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.47 
 
 
929 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3646  molybdopterin oxidoreductase  35.22 
 
 
746 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.457481  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.36 
 
 
766 aa  422  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1779  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.86 
 
 
904 aa  421  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.377871  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1002  molybdopterin oxidoreductase  34.45 
 
 
946 aa  421  1e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2330  molybdopterin oxidoreductase  35.81 
 
 
952 aa  422  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.505479  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2841  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  35.5 
 
 
952 aa  420  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.951842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1404  molybdopterin oxidoreductase  34.54 
 
 
955 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.931787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4566  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 
724 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247361  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  36.28 
 
 
752 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2310  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  36.55 
 
 
894 aa  419  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3462  molybdopterin oxidoreductase  34.31 
 
 
757 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.53651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1070  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.08 
 
 
734 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  36.15 
 
 
752 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.22 
 
 
727 aa  411  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  34 
 
 
958 aa  412  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2777  molybdopterin oxidoreductase  36.36 
 
 
1173 aa  411  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2595  molybdopterin oxidoreductase  34.17 
 
 
953 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  36.59 
 
 
951 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  35.75 
 
 
752 aa  409  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2105  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  34.76 
 
 
986 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568723  normal  0.887876 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  34.33 
 
 
1176 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  33.87 
 
 
1180 aa  404  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.33 
 
 
951 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.33 
 
 
951 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.53 
 
 
951 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.33 
 
 
951 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  36.46 
 
 
951 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1235  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  34.62 
 
 
729 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.117826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.2 
 
 
951 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  34.42 
 
 
716 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.2 
 
 
951 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.05 
 
 
695 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  34.72 
 
 
933 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  34.2 
 
 
1228 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 
1171 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  34.77 
 
 
743 aa  391  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  33.74 
 
 
1188 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3279  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  32.1 
 
 
1003 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358358  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.24 
 
 
904 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2643  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  35.03 
 
 
743 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.06 
 
 
745 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0053  molybdopterin oxidoreductase  32.79 
 
 
658 aa  386  1e-105  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.02 
 
 
879 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  35.3 
 
 
1357 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1056  periplasmic nitrate reductase, large subunit  32.33 
 
 
770 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.98 
 
 
677 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.81 
 
 
1338 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  35.95 
 
 
759 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2532  molybdopterin oxidoreductase  31.97 
 
 
967 aa  375  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.687904  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3491  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 
1312 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  32.45 
 
 
755 aa  372  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  34.82 
 
 
1409 aa  372  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  35.03 
 
 
1341 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5799  molybdopterin oxidoreductase  33.92 
 
 
1395 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.538551  normal  0.774605 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3865  molybdopterin oxidoreductase  34.05 
 
 
1395 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.17729  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 
741 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  35.18 
 
 
1232 aa  369  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 
1397 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4504  molybdopterin oxidoreductase  34.05 
 
 
1395 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.8 
 
 
893 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  34.95 
 
 
1407 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 
1397 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  35.87 
 
 
1396 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.53 
 
 
688 aa  365  2e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.03 
 
 
688 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3016  molybdopterin oxidoreductase  33.02 
 
 
1317 aa  363  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.253668  normal  0.632425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.29 
 
 
1383 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  31.59 
 
 
687 aa  363  9e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  32.8 
 
 
899 aa  363  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.72 
 
 
688 aa  362  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  35.1 
 
 
1342 aa  361  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  33.51 
 
 
1395 aa  362  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  35.2 
 
 
1405 aa  359  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.61 
 
 
917 aa  358  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>