More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4198 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  100 
 
 		 679 aa  1379    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  39 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 725 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  30.29 
 
 		 764 aa  261  3e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  30.23 
 
 		 691 aa  254  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 		 717 aa  249  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  30.98 
 
 		 733 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  31.1 
 
 		 720 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  32.19 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  28.02 
 
 		 713 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.32 
 
 		 732 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  29.48 
 
 		 721 aa  231  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  27.54 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  30.81 
 
 		 715 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  29.05 
 
 		 721 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  29.05 
 
 		 721 aa  228  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  29.71 
 
 		 727 aa  228  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 		 726 aa  227  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  26.42 
 
 		 729 aa  225  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  31.05 
 
 		 687 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  30.21 
 
 		 702 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  28.94 
 
 		 720 aa  221  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  27.55 
 
 		 738 aa  216  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 		 704 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  29.39 
 
 		 702 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  25.37 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.92 
 
 		 739 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.38 
 
 		 773 aa  210  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  29.58 
 
 		 701 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  27.32 
 
 		 804 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  29.05 
 
 		 702 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  27.28 
 
 		 777 aa  209  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  25.58 
 
 		 1299 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.32 
 
 		 849 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  32.44 
 
 		 738 aa  207  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.27 
 
 		 721 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.16 
 
 		 804 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.16 
 
 		 804 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.19 
 
 		 773 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  29.19 
 
 		 702 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.16 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  30.34 
 
 		 702 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 		 747 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  28.55 
 
 		 702 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  30.18 
 
 		 702 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  28.12 
 
 		 739 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.63 
 
 		 733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  29.26 
 
 		 732 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  32 
 
 		 739 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  28.76 
 
 		 702 aa  195  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.37 
 
 		 769 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  30.86 
 
 		 753 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 		 744 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  31.52 
 
 		 757 aa  167  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.28 
 
 		 986 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 		 768 aa  163  9e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0336  molybdopterin oxidoreductase  27.6 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  28.43 
 
 		 746 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.53 
 
 		 657 aa  160  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2823  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.31 
 
 		 897 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.07 
 
 		 988 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.07 
 
 		 988 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.56 
 
 		 657 aa  158  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.27 
 
 		 676 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.5 
 
 		 893 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  31.51 
 
 		 654 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.25 
 
 		 893 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  28.6 
 
 		 745 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 688 aa  155  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 691 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2497  molybdopterin oxidoreductase  27.1 
 
 		 892 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.790311 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.74 
 
 		 676 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.88 
 
 		 749 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.62 
 
 		 988 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 		 691 aa  153  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.35 
 
 		 691 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.35 
 
 		 691 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.35 
 
 		 691 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.61 
 
 		 685 aa  152  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 		 879 aa  151  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2321  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.14 
 
 		 835 aa  151  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.269586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.82 
 
 		 835 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  24.68 
 
 		 899 aa  151  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.35 
 
 		 685 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  28.09 
 
 		 753 aa  151  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.23 
 
 		 886 aa  151  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2729  molybdopterin oxidoreductase  24.16 
 
 		 902 aa  150  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.37 
 
 		 676 aa  150  7e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 		 674 aa  150  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.8 
 
 		 961 aa  150  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.8 
 
 		 963 aa  150  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.55 
 
 		 987 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  27.97 
 
 		 715 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 		 691 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 		 925 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 1410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 		 769 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 		 691 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>