More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1778 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
738 aa  1523    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 
725 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  28.27 
 
 
691 aa  239  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  28.02 
 
 
702 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  28.35 
 
 
702 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  27.99 
 
 
717 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  28.11 
 
 
702 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  30.09 
 
 
721 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  28.55 
 
 
671 aa  233  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  28.57 
 
 
733 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  30.09 
 
 
721 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  30.09 
 
 
721 aa  231  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 
743 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  27.58 
 
 
732 aa  229  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  28.9 
 
 
720 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  29.97 
 
 
720 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 
701 aa  224  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  28.29 
 
 
715 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  26.28 
 
 
726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  33.48 
 
 
739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  27.02 
 
 
747 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  27.05 
 
 
702 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  27.4 
 
 
702 aa  210  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  27.35 
 
 
702 aa  210  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  27.12 
 
 
702 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  28.73 
 
 
739 aa  207  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  26.8 
 
 
753 aa  204  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.53 
 
 
733 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  24.62 
 
 
729 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  26.84 
 
 
702 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  26.21 
 
 
713 aa  204  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  25.54 
 
 
741 aa  204  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  26.32 
 
 
757 aa  201  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.19 
 
 
721 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  25.29 
 
 
704 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  27.55 
 
 
679 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.31 
 
 
732 aa  197  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
747 aa  196  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  27.85 
 
 
687 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  27.11 
 
 
764 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  31.86 
 
 
738 aa  190  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.71 
 
 
739 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.97 
 
 
769 aa  182  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.22 
 
 
849 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.22 
 
 
773 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.22 
 
 
804 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 
777 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 
804 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.22 
 
 
777 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.22 
 
 
804 aa  181  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  27.58 
 
 
1299 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  26.01 
 
 
726 aa  178  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.98 
 
 
773 aa  174  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  25.33 
 
 
727 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  29.66 
 
 
768 aa  170  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  23.33 
 
 
731 aa  167  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  29.76 
 
 
753 aa  165  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.77 
 
 
729 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  28.01 
 
 
769 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
791 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 
716 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  26.54 
 
 
731 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  28.32 
 
 
835 aa  158  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 
760 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.36 
 
 
730 aa  155  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  27.03 
 
 
733 aa  154  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.7 
 
 
749 aa  154  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  26.72 
 
 
1055 aa  153  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 
745 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  22.36 
 
 
731 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 
744 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  23.18 
 
 
758 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  29.02 
 
 
754 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.63 
 
 
757 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 
734 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  27.39 
 
 
752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  23.77 
 
 
758 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  23.8 
 
 
758 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.81 
 
 
722 aa  148  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  23.68 
 
 
758 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.49 
 
 
677 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  24.24 
 
 
700 aa  147  9e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  27.17 
 
 
752 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  27.17 
 
 
752 aa  147  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  29.8 
 
 
718 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.19 
 
 
760 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.93 
 
 
695 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 
759 aa  144  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  26.22 
 
 
746 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  27.9 
 
 
909 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 
731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  23.79 
 
 
731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.55 
 
 
685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
718 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  29.35 
 
 
718 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  29.18 
 
 
884 aa  139  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.38 
 
 
708 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 
728 aa  139  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  24.29 
 
 
747 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>