More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2405 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  46.59 
 
 
702 aa  668    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  47.32 
 
 
732 aa  692    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  47.57 
 
 
702 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  46.58 
 
 
701 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
1299 aa  2699    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  44.95 
 
 
717 aa  663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  46.31 
 
 
702 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  45.84 
 
 
741 aa  682    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  48.47 
 
 
702 aa  691    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  46.66 
 
 
702 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  43.58 
 
 
726 aa  646    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  47.6 
 
 
729 aa  707    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  46.04 
 
 
702 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  45.77 
 
 
702 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  44.5 
 
 
764 aa  670    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  46.59 
 
 
702 aa  671    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  48.04 
 
 
691 aa  724    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  43.69 
 
 
704 aa  628  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  42.92 
 
 
713 aa  619  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.5 
 
 
773 aa  604  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  41.77 
 
 
747 aa  580  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  42.98 
 
 
731 aa  582  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.49 
 
 
732 aa  576  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  41.6 
 
 
687 aa  568  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.45 
 
 
739 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.99 
 
 
721 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  39.3 
 
 
739 aa  526  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  38.38 
 
 
738 aa  513  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  39.11 
 
 
739 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  36.68 
 
 
753 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  36.44 
 
 
757 aa  482  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.08 
 
 
733 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  36.24 
 
 
733 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  36.28 
 
 
743 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  36.12 
 
 
715 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  34.53 
 
 
725 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  32.87 
 
 
727 aa  385  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4084  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.72 
 
 
548 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.715541  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  33.01 
 
 
726 aa  362  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  30.33 
 
 
720 aa  351  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  30.48 
 
 
721 aa  339  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  30.48 
 
 
721 aa  339  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  30.2 
 
 
721 aa  338  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  38.66 
 
 
768 aa  336  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3035  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  41.43 
 
 
454 aa  331  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0927289  normal  0.1077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  29.59 
 
 
720 aa  329  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13123  NADPH:adrenodoxin oxidoreductase fprA  41.27 
 
 
456 aa  324  8e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.611149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6598  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.93 
 
 
458 aa  322  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4462  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.98 
 
 
561 aa  320  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.409413  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4053  ferredoxin--NADP(+) reductase  40.22 
 
 
461 aa  320  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.172833 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4549  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.98 
 
 
561 aa  320  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.36171  normal  0.408424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3878  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.82 
 
 
559 aa  318  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10903  NADPH:adrenodoxin oxidoreductase fprB  34.51 
 
 
575 aa  317  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5031  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.03 
 
 
559 aa  315  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0330  ferredoxin--NADP(+) reductase  41.63 
 
 
455 aa  315  3.9999999999999997e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4845  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.63 
 
 
561 aa  313  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0779804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3267  ferredoxin--NADP(+) reductase  40 
 
 
470 aa  309  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0005  ferredoxin--NADP(+) reductase  37.36 
 
 
467 aa  309  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4240  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.68 
 
 
464 aa  308  4.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185305  normal  0.261729 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4255  ferredoxin--NADP(+) reductase  37.53 
 
 
467 aa  308  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1720  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.15 
 
 
557 aa  307  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.349649  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1014  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.7 
 
 
464 aa  303  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000338118  hitchhiker  0.000000403971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4452  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 
458 aa  298  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2469  Ferredoxin--NADP(+) reductase  38.5 
 
 
462 aa  298  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2384  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.1 
 
 
478 aa  297  9e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.119474  decreased coverage  0.00102893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1578  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
458 aa  296  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1910  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.52 
 
 
459 aa  296  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1757  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.9 
 
 
452 aa  295  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0582734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1607  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
458 aa  295  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
458 aa  295  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3438  Ferredoxin--NADP(+) reductase  37.61 
 
 
446 aa  295  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2847  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.81 
 
 
482 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3296  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.02 
 
 
446 aa  285  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0019  Ferredoxin--NADP(+) reductase  35.54 
 
 
448 aa  285  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.71 
 
 
510 aa  284  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.922608  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1955  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.11 
 
 
467 aa  283  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3414  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.71 
 
 
445 aa  283  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.883786  normal  0.747505 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4411  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.25 
 
 
463 aa  282  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1347  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.4 
 
 
451 aa  280  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0557  Ferredoxin--NADP(+) reductase  35.78 
 
 
463 aa  279  2e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.386754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3682  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.65 
 
 
464 aa  278  6e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.62 
 
 
544 aa  278  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.03 
 
 
455 aa  277  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.577739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1092  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.14 
 
 
455 aa  276  3e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.493429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07580  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain-like oxidoreductase  35.84 
 
 
457 aa  275  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.102843 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0656  Ferredoxin--NADP(+) reductase  35.31 
 
 
460 aa  274  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.655119  normal  0.594409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2100  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.05 
 
 
432 aa  273  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00331224  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7630  hypothetical protein  34.63 
 
 
451 aa  272  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.497873  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03420  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain-like oxidoreductase  34.65 
 
 
450 aa  271  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672031  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2698  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.87 
 
 
461 aa  271  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.323844  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1915  ferredoxin/ferredoxin--NADP reductase, putative  37.39 
 
 
459 aa  270  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.317551  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3195  Ferredoxin--NADP(+) reductase  35.75 
 
 
460 aa  267  8.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221459  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_2735  predicted protein  32.16 
 
 
481 aa  266  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.477592  normal  0.291608 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_2736  predicted protein  32.16 
 
 
481 aa  266  2e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.299557  normal  0.0246971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1053  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.17 
 
 
439 aa  265  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175649  normal  0.175331 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17680  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain-like oxidoreductase  32.77 
 
 
472 aa  264  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10030  NADPH-dependent glutamate synthase beta chain-like oxidoreductase  32.63 
 
 
476 aa  262  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00159222  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  35.68 
 
 
462 aa  261  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.916433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0845  putative ferredoxin--NADP(+) reductase (NADPH:adrenodoxin oxidoreductase)  36.85 
 
 
469 aa  261  6e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0008  ferredoxin/ferredoxin-NADP reductase family protein  32.77 
 
 
492 aa  258  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000479835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>