More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1109 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  88.03 
 
 		 702 aa  1260    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  48.48 
 
 		 764 aa  696    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  77.3 
 
 		 732 aa  1121    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  78.6 
 
 		 702 aa  1131    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  88.18 
 
 		 702 aa  1264    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  52.98 
 
 		 691 aa  740    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  76.78 
 
 		 701 aa  1101    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  47.72 
 
 		 717 aa  676    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  78.63 
 
 		 702 aa  1126    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 702 aa  1442    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  48.66 
 
 		 741 aa  697    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  74.93 
 
 		 702 aa  1078    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  44.14 
 
 		 726 aa  650    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  46.88 
 
 		 704 aa  651    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  75.36 
 
 		 702 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  46.66 
 
 		 1299 aa  678    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  45.79 
 
 		 729 aa  660    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  87.61 
 
 		 702 aa  1253    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  47.52 
 
 		 687 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  44.37 
 
 		 713 aa  616  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  47.05 
 
 		 731 aa  605  9.999999999999999e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.05 
 
 		 773 aa  602  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  45.32 
 
 		 747 aa  587  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.46 
 
 		 732 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  44.5 
 
 		 738 aa  581  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.55 
 
 		 721 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  43.57 
 
 		 739 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  43.68 
 
 		 739 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  42.97 
 
 		 739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  39.78 
 
 		 733 aa  488  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  38.99 
 
 		 753 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  38.62 
 
 		 757 aa  475  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  37.15 
 
 		 725 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  37.55 
 
 		 743 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  37.72 
 
 		 733 aa  419  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  37.62 
 
 		 715 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  34.41 
 
 		 727 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  44.15 
 
 		 768 aa  375  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 726 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  33.97 
 
 		 721 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  33.97 
 
 		 721 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  34.11 
 
 		 721 aa  345  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  33.02 
 
 		 720 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  31.88 
 
 		 720 aa  320  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  27.05 
 
 		 738 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.75 
 
 		 671 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.98 
 
 		 749 aa  193  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  30.82 
 
 		 753 aa  189  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  25.66 
 
 		 746 aa  187  7e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 		 698 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  28.55 
 
 		 679 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.43 
 
 		 769 aa  183  8.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.16 
 
 		 804 aa  178  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.16 
 
 		 773 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.16 
 
 		 804 aa  178  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 		 804 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.16 
 
 		 777 aa  177  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  28.79 
 
 		 769 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 		 777 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.16 
 
 		 849 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.47 
 
 		 757 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  27.6 
 
 		 835 aa  170  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  28.98 
 
 		 754 aa  169  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.55 
 
 		 907 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 		 715 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  28.16 
 
 		 752 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  28.16 
 
 		 752 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  27.96 
 
 		 752 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  27.99 
 
 		 906 aa  167  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.05 
 
 		 927 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  27.79 
 
 		 908 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  28.83 
 
 		 747 aa  164  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.14 
 
 		 886 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.69 
 
 		 917 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.98 
 
 		 948 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.26 
 
 		 948 aa  160  8e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3023  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.75 
 
 		 982 aa  160  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0162015  normal  0.0152175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  25.76 
 
 		 982 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.29 
 
 		 700 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.43 
 
 		 722 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.17 
 
 		 905 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  24.35 
 
 		 957 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.98 
 
 		 698 aa  158  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2799  nitrate reductase  24.18 
 
 		 734 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0851567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  24.03 
 
 		 734 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.12 
 
 		 948 aa  157  9e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.74 
 
 		 729 aa  156  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.36 
 
 		 948 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.18 
 
 		 979 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  26.79 
 
 		 901 aa  155  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 688 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  25.32 
 
 		 745 aa  154  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.35 
 
 		 983 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.56 
 
 		 685 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.72 
 
 		 688 aa  153  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.53 
 
 		 983 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  23.58 
 
 		 692 aa  153  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2370  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 954 aa  153  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  24.76 
 
 		 692 aa  153  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>