More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1073 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 835 aa  1742    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  53.9 
 
 		 746 aa  626  1e-178  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  45.26 
 
 		 747 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.3 
 
 		 773 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.3 
 
 		 849 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  36.3 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  36.3 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.3 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.3 
 
 		 804 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.3 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  36.43 
 
 		 769 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  34.7 
 
 		 769 aa  320  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  33.57 
 
 		 753 aa  314  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  33.97 
 
 		 749 aa  300  9e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  33.97 
 
 		 752 aa  299  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  33.84 
 
 		 752 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  33.84 
 
 		 752 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.89 
 
 		 757 aa  292  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  32.79 
 
 		 754 aa  290  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 		 725 aa  206  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  26.78 
 
 		 733 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  26.78 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  26.75 
 
 		 715 aa  195  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  28.15 
 
 		 764 aa  195  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  28.22 
 
 		 691 aa  188  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 		 717 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  28.63 
 
 		 727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  28.22 
 
 		 702 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 		 704 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  25 
 
 		 741 aa  177  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  25.52 
 
 		 726 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  27.87 
 
 		 739 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.71 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.59 
 
 		 739 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  27.63 
 
 		 732 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  26.92 
 
 		 702 aa  171  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  27.6 
 
 		 702 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.77 
 
 		 721 aa  170  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 		 701 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  26.67 
 
 		 687 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.58 
 
 		 733 aa  168  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.11 
 
 		 657 aa  169  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  26.47 
 
 		 702 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  25.3 
 
 		 713 aa  168  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  27.84 
 
 		 702 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  27.54 
 
 		 702 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  27.1 
 
 		 702 aa  164  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  26.38 
 
 		 1299 aa  164  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  26.9 
 
 		 702 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 		 747 aa  163  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  25.62 
 
 		 729 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.31 
 
 		 722 aa  162  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  26.77 
 
 		 726 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 891 aa  158  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 738 aa  158  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.15 
 
 		 688 aa  157  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 945 aa  157  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 671 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.17 
 
 		 657 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  24.24 
 
 		 662 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  23.72 
 
 		 739 aa  154  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.77 
 
 		 668 aa  152  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.24 
 
 		 685 aa  153  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.32 
 
 		 738 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.36 
 
 		 773 aa  150  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  25.1 
 
 		 720 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 		 973 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  25.63 
 
 		 720 aa  149  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.9 
 
 		 979 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  27.81 
 
 		 745 aa  147  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.36 
 
 		 917 aa  147  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 		 768 aa  146  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  23.63 
 
 		 662 aa  147  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 711 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  25.98 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  25.98 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  25.98 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.86 
 
 		 924 aa  146  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.91 
 
 		 986 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.06 
 
 		 961 aa  145  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  26.71 
 
 		 753 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.56 
 
 		 766 aa  144  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.69 
 
 		 676 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.68 
 
 		 924 aa  143  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.29 
 
 		 676 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.9 
 
 		 676 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.6 
 
 		 673 aa  142  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  24.77 
 
 		 731 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 		 700 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 		 695 aa  141  4.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.55 
 
 		 963 aa  141  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  25.56 
 
 		 757 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1860  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 		 734 aa  139  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000669527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.44 
 
 		 957 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  25.67 
 
 		 669 aa  138  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.31 
 
 		 1111 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.16 
 
 		 963 aa  138  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 		 715 aa  137  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  22.87 
 
 		 762 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  27.9 
 
 		 715 aa  136  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>