More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3288 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  82.27 
 
 		 752 aa  1191    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  76.55 
 
 		 749 aa  1116    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  100 
 
 		 753 aa  1532    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  82.3 
 
 		 752 aa  1192    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  52.56 
 
 		 769 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  82.3 
 
 		 752 aa  1192    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  53.68 
 
 		 757 aa  689    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  85.27 
 
 		 754 aa  1252    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.85 
 
 		 849 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  44.85 
 
 		 804 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  44.94 
 
 		 777 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.81 
 
 		 773 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.81 
 
 		 804 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.81 
 
 		 804 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.81 
 
 		 777 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.53 
 
 		 769 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  34.08 
 
 		 747 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  34.44 
 
 		 746 aa  395  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  33.57 
 
 		 835 aa  337  5.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  30.55 
 
 		 725 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  29.24 
 
 		 743 aa  254  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  29.24 
 
 		 733 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  29.18 
 
 		 715 aa  241  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  29.59 
 
 		 739 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  26.39 
 
 		 720 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 		 704 aa  211  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  32.13 
 
 		 691 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  26.23 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  26.09 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  26.09 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  26.16 
 
 		 732 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  30.82 
 
 		 702 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  28.06 
 
 		 747 aa  204  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  30.06 
 
 		 701 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  29.8 
 
 		 702 aa  200  7e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  28.22 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  29.8 
 
 		 702 aa  197  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  28.01 
 
 		 739 aa  197  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  29.59 
 
 		 702 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  29.39 
 
 		 702 aa  196  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  29.37 
 
 		 702 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  29.39 
 
 		 702 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  29.39 
 
 		 702 aa  194  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 		 717 aa  193  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.27 
 
 		 739 aa  193  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  31.24 
 
 		 687 aa  192  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  28.67 
 
 		 729 aa  191  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  28.21 
 
 		 713 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.66 
 
 		 773 aa  184  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.16 
 
 		 733 aa  180  8e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  28.29 
 
 		 731 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  27.19 
 
 		 764 aa  178  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  24.79 
 
 		 720 aa  177  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  28.34 
 
 		 738 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.05 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  29.54 
 
 		 738 aa  171  6e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  28.54 
 
 		 727 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  31.3 
 
 		 768 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  24.48 
 
 		 1299 aa  165  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.57 
 
 		 721 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.38 
 
 		 722 aa  163  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.48 
 
 		 657 aa  163  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3992  molybdopterin oxidoreductase  45.7 
 
 		 197 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  26.61 
 
 		 753 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 		 726 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.18 
 
 		 657 aa  160  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.95 
 
 		 668 aa  159  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  25.26 
 
 		 741 aa  158  4e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  26.68 
 
 		 757 aa  157  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  25.23 
 
 		 1180 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.61 
 
 		 732 aa  151  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  27.77 
 
 		 692 aa  150  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 931 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  27.53 
 
 		 708 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 		 891 aa  148  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  26.65 
 
 		 673 aa  147  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.31 
 
 		 927 aa  147  9e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  24.67 
 
 		 1228 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 		 708 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0764  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.98 
 
 		 915 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.136894 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 		 731 aa  145  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  28.25 
 
 		 698 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 		 731 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.02 
 
 		 734 aa  144  6e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  29.31 
 
 		 715 aa  144  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 		 691 aa  144  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 698 aa  144  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  29.94 
 
 		 684 aa  144  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.13 
 
 		 724 aa  144  9e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 		 1405 aa  143  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 		 671 aa  142  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 		 669 aa  142  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 		 758 aa  142  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 		 691 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  28.94 
 
 		 714 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 		 709 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63173 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>