More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10199 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  100 
 
 
749 aa  1537    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  78.78 
 
 
752 aa  1122    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  76.55 
 
 
753 aa  1090    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  79.18 
 
 
752 aa  1130    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  52.79 
 
 
757 aa  686    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  53.22 
 
 
769 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  79.18 
 
 
752 aa  1130    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  77.93 
 
 
754 aa  1136    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.66 
 
 
804 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.66 
 
 
773 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.66 
 
 
849 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 
804 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.66 
 
 
777 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  44.66 
 
 
777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  44.66 
 
 
804 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.06 
 
 
769 aa  568  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  33.2 
 
 
746 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  33.86 
 
 
747 aa  389  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  33.52 
 
 
835 aa  325  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  29.67 
 
 
743 aa  262  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  29.61 
 
 
733 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  30.2 
 
 
725 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  29.44 
 
 
715 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  29.59 
 
 
739 aa  222  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  26.86 
 
 
702 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  27.02 
 
 
701 aa  207  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  26.85 
 
 
721 aa  207  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  26.72 
 
 
721 aa  207  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  26.72 
 
 
721 aa  207  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  29.13 
 
 
702 aa  201  6e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  26.93 
 
 
764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  25.26 
 
 
726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  26.98 
 
 
702 aa  198  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  28.98 
 
 
702 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  24.93 
 
 
713 aa  195  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  27.61 
 
 
739 aa  196  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  29.61 
 
 
702 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  31.37 
 
 
691 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  28.02 
 
 
732 aa  194  4e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.42 
 
 
739 aa  189  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 
738 aa  187  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  29.18 
 
 
702 aa  187  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  25.77 
 
 
720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.65 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  29.85 
 
 
704 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.56 
 
 
732 aa  185  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 
747 aa  184  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  28.57 
 
 
702 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  28.57 
 
 
702 aa  184  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
717 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  27.36 
 
 
731 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  24.5 
 
 
729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  26.55 
 
 
727 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 
726 aa  178  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.45 
 
 
773 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  30 
 
 
687 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.16 
 
 
721 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  31.17 
 
 
768 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  28.12 
 
 
720 aa  161  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3992  molybdopterin oxidoreductase  43.98 
 
 
197 aa  160  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  24.14 
 
 
1299 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.96 
 
 
657 aa  154  4e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  25.99 
 
 
753 aa  153  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.15 
 
 
891 aa  152  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
729 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.48 
 
 
738 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.26 
 
 
722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  25.97 
 
 
741 aa  147  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.03 
 
 
668 aa  146  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  27.94 
 
 
908 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  25.97 
 
 
732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  26.57 
 
 
757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  27.77 
 
 
745 aa  141  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.22 
 
 
677 aa  140  6e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 
671 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 
673 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
726 aa  139  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
726 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.23 
 
 
657 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
726 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.35 
 
 
718 aa  137  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.99 
 
 
676 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.76 
 
 
692 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  28.46 
 
 
654 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 
691 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  28.88 
 
 
679 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 
692 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 
1180 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.58 
 
 
676 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 
931 aa  135  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  27.69 
 
 
693 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2099  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:BFD-like [2Fe-2S]-binding region  27.46 
 
 
906 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0090203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  23.54 
 
 
1228 aa  134  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2168  molydopterin dinucleotide-binding region  27.23 
 
 
693 aa  134  9e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.68 
 
 
674 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.65 
 
 
929 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.67 
 
 
674 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.9 
 
 
674 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1147  molybdopterin oxidoreductase  29.16 
 
 
933 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000889263  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  24.01 
 
 
666 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>