125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3992 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3992  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
197 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  91.88 
 
 
769 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  43.98 
 
 
749 aa  160  9e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  44.32 
 
 
754 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  43.62 
 
 
752 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  43.62 
 
 
752 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  43.62 
 
 
752 aa  151  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  45.16 
 
 
753 aa  143  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.57 
 
 
769 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.78 
 
 
804 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.78 
 
 
777 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.78 
 
 
804 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.78 
 
 
773 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  39.78 
 
 
849 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  39.78 
 
 
804 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  39.78 
 
 
777 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.55 
 
 
757 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  37.89 
 
 
746 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  33.51 
 
 
835 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 
747 aa  85.1  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  32.8 
 
 
715 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  32.8 
 
 
733 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  32.78 
 
 
743 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  27.13 
 
 
729 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  33.54 
 
 
702 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  28.74 
 
 
704 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  33.76 
 
 
702 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  28.05 
 
 
741 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 
701 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4111  molybdopterin oxidoreductase  42.86 
 
 
647 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.191585  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  32.33 
 
 
725 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.6 
 
 
773 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 
731 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  32.43 
 
 
732 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.78 
 
 
739 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  29.93 
 
 
702 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  31.95 
 
 
721 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  31.95 
 
 
721 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  31.95 
 
 
721 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  31.91 
 
 
720 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  31.29 
 
 
702 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  34.86 
 
 
747 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  30.71 
 
 
753 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  31.37 
 
 
717 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  30.87 
 
 
702 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 
724 aa  53.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  31.76 
 
 
702 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.56 
 
 
692 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  27.11 
 
 
687 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 
691 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  31.76 
 
 
702 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  31.76 
 
 
702 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  32.99 
 
 
713 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  22.73 
 
 
726 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  33.33 
 
 
529 aa  50.4  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  25.79 
 
 
695 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  29.14 
 
 
720 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  30.08 
 
 
757 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.18 
 
 
903 aa  48.9  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  25.79 
 
 
1299 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  26.87 
 
 
745 aa  48.5  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.47 
 
 
541 aa  48.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  34.04 
 
 
744 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 
738 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  30.13 
 
 
739 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 
673 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.78 
 
 
688 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  40.62 
 
 
758 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4046  molybdopterin oxidoreductase  34.65 
 
 
779 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  29.29 
 
 
749 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.57 
 
 
792 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.57 
 
 
792 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 
836 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  46.3 
 
 
845 aa  45.1  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 
905 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  31.91 
 
 
527 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4544  assimilatory nitrate reductase (ferredoxin) precursor  28.87 
 
 
727 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.52 
 
 
688 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  30.88 
 
 
716 aa  43.9  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.57 
 
 
792 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.57 
 
 
792 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  28.57 
 
 
792 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1969  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 
703 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  29.13 
 
 
874 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.42 
 
 
679 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  45.45 
 
 
1387 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3861  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  27.67 
 
 
816 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0187524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0233  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.62 
 
 
838 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.900015  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6438  molybdopterin oxidoreductase  32.29 
 
 
964 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.76 
 
 
893 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4696  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  28.95 
 
 
847 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0792872  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 
1357 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2272  nitrate reductase  32.47 
 
 
743 aa  43.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  38.36 
 
 
777 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  32.53 
 
 
526 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 
1396 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0359  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  29.11 
 
 
816 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0222521  hitchhiker  0.00628984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  29.7 
 
 
756 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.12 
 
 
911 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.33 
 
 
732 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>