More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6518 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  53.03 
 
 		 747 aa  705    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  46.17 
 
 		 691 aa  649    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  49.48 
 
 		 721 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 773 aa  1541    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  48.96 
 
 		 732 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  48.51 
 
 		 702 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  50.98 
 
 		 739 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  48.39 
 
 		 702 aa  653    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  49.29 
 
 		 739 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  45.72 
 
 		 764 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  48.01 
 
 		 702 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  43.48 
 
 		 729 aa  635  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  47.36 
 
 		 738 aa  631  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  49.1 
 
 		 739 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  45.02 
 
 		 732 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  46.98 
 
 		 702 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  46.98 
 
 		 702 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  47.05 
 
 		 702 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  45.67 
 
 		 702 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  41.75 
 
 		 704 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  42.69 
 
 		 1299 aa  612  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  45.3 
 
 		 702 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  45.29 
 
 		 701 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  41.99 
 
 		 741 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  42.34 
 
 		 717 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  41.01 
 
 		 726 aa  598  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  40.52 
 
 		 713 aa  569  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  42.58 
 
 		 753 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.42 
 
 		 733 aa  519  1e-146  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  44.23 
 
 		 768 aa  512  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  40.85 
 
 		 757 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  39.71 
 
 		 687 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 		 725 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  37.37 
 
 		 743 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  37.63 
 
 		 733 aa  426  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  37.58 
 
 		 715 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  47.45 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  35.16 
 
 		 726 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  34.91 
 
 		 727 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  33.16 
 
 		 721 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  33.16 
 
 		 721 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  33.03 
 
 		 721 aa  323  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.3 
 
 		 720 aa  310  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  31.59 
 
 		 720 aa  298  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.27 
 
 		 849 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  28.27 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.14 
 
 		 773 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.14 
 
 		 777 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.14 
 
 		 804 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.14 
 
 		 804 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 		 769 aa  202  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  32.45 
 
 		 671 aa  200  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  31.97 
 
 		 679 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 		 747 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  30.04 
 
 		 698 aa  183  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.05 
 
 		 760 aa  182  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  29.16 
 
 		 1135 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  28.41 
 
 		 752 aa  178  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  26.28 
 
 		 746 aa  178  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.28 
 
 		 731 aa  178  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  28.02 
 
 		 754 aa  178  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 757 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 668 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  30.04 
 
 		 749 aa  172  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  30.2 
 
 		 695 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  29.2 
 
 		 758 aa  170  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  30.29 
 
 		 753 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.71 
 
 		 685 aa  167  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  29.27 
 
 		 1143 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.65 
 
 		 900 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.24 
 
 		 738 aa  167  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 		 760 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  26.32 
 
 		 750 aa  165  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 		 760 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  28.68 
 
 		 1139 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.18 
 
 		 760 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.89 
 
 		 893 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.34 
 
 		 899 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.33 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.33 
 
 		 764 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 760 aa  162  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  27.49 
 
 		 692 aa  162  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  29.75 
 
 		 744 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 		 729 aa  160  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 		 700 aa  159  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 764 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  29.37 
 
 		 752 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  29.37 
 
 		 752 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  30.26 
 
 		 769 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 		 756 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.84 
 
 		 764 aa  157  9e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  26.51 
 
 		 739 aa  156  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.19 
 
 		 879 aa  155  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25.34 
 
 		 760 aa  155  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  26.17 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  25.23 
 
 		 749 aa  153  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  31.11 
 
 		 759 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>