More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2009 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  98.88 
 
 
743 aa  1420    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  57.97 
 
 
725 aa  787    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  51.47 
 
 
727 aa  666    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  100 
 
 
715 aa  1432    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  100 
 
 
733 aa  1432    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  50.97 
 
 
726 aa  650    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  37.74 
 
 
717 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  36.3 
 
 
729 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  40.81 
 
 
747 aa  456  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  39.56 
 
 
702 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  37.5 
 
 
691 aa  452  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  38.19 
 
 
702 aa  445  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  37.88 
 
 
701 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  38.66 
 
 
702 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  35.76 
 
 
704 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  39.56 
 
 
702 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  40.03 
 
 
739 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  36.12 
 
 
1299 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  34.65 
 
 
726 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  36.98 
 
 
732 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.58 
 
 
773 aa  427  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  34.63 
 
 
741 aa  428  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  39.26 
 
 
733 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  35.79 
 
 
764 aa  424  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  37.62 
 
 
702 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  33.57 
 
 
713 aa  414  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  37.65 
 
 
739 aa  412  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.49 
 
 
732 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  37.08 
 
 
687 aa  412  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  36.49 
 
 
738 aa  412  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  37.02 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  36.88 
 
 
702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  36.84 
 
 
702 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  39 
 
 
731 aa  402  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.16 
 
 
739 aa  399  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  37.75 
 
 
757 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  37.04 
 
 
753 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.35 
 
 
721 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  36.15 
 
 
721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  36.15 
 
 
721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  36.15 
 
 
721 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  35.91 
 
 
720 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  35.31 
 
 
720 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 
804 aa  291  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.41 
 
 
769 aa  291  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 
777 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.93 
 
 
849 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.8 
 
 
777 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.8 
 
 
773 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.8 
 
 
804 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.8 
 
 
804 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  39.57 
 
 
768 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  29.4 
 
 
749 aa  259  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 
671 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  28.76 
 
 
746 aa  248  3e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  29.24 
 
 
754 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  27.79 
 
 
752 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  27.79 
 
 
752 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  27.79 
 
 
752 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.12 
 
 
738 aa  228  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.11 
 
 
674 aa  220  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  29.01 
 
 
753 aa  220  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.19 
 
 
679 aa  217  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  30.81 
 
 
679 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 
684 aa  208  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  30.53 
 
 
693 aa  206  8e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.75 
 
 
835 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  32.33 
 
 
769 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  27.88 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.3 
 
 
703 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.39 
 
 
685 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  27.21 
 
 
692 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 
747 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 
697 aa  197  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 
698 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 
698 aa  196  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.47 
 
 
688 aa  195  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
718 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 
673 aa  194  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
718 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.5 
 
 
703 aa  194  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 
718 aa  194  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  27.73 
 
 
674 aa  193  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  28.26 
 
 
698 aa  192  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 
694 aa  191  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 
891 aa  191  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
726 aa  190  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.26 
 
 
893 aa  188  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 
688 aa  188  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.86 
 
 
701 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 
726 aa  187  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  28.89 
 
 
688 aa  187  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.42 
 
 
757 aa  186  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
727 aa  185  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 
726 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.23 
 
 
688 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.54 
 
 
708 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.75 
 
 
758 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.34 
 
 
900 aa  180  8e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>