More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2249 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  100 
 
 		 720 aa  1458    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  76.5 
 
 		 721 aa  1153    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  76.36 
 
 		 721 aa  1150    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  79.55 
 
 		 720 aa  1190    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  76.36 
 
 		 721 aa  1150    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  34.29 
 
 		 702 aa  369  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  32.09 
 
 		 726 aa  369  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  34.16 
 
 		 702 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  33.15 
 
 		 691 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  30.85 
 
 		 717 aa  361  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  36.49 
 
 		 725 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  33.42 
 
 		 701 aa  352  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  33.33 
 
 		 702 aa  351  3e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  35.35 
 
 		 733 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.08 
 
 		 739 aa  349  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  35.05 
 
 		 743 aa  346  8e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  30.54 
 
 		 729 aa  344  2.9999999999999997e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  32.18 
 
 		 702 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  35.22 
 
 		 715 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  29.33 
 
 		 1299 aa  335  1e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  30.92 
 
 		 713 aa  336  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  31.91 
 
 		 732 aa  333  6e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.83 
 
 		 733 aa  332  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  32.24 
 
 		 702 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  32.29 
 
 		 702 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  32.1 
 
 		 702 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  32.38 
 
 		 702 aa  326  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  34.22 
 
 		 747 aa  323  9.000000000000001e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  33.43 
 
 		 687 aa  322  9.999999999999999e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  34.38 
 
 		 731 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  33.81 
 
 		 739 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  32.6 
 
 		 727 aa  319  9e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.85 
 
 		 773 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  29.72 
 
 		 741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 		 704 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  32.27 
 
 		 726 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  33.42 
 
 		 739 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  29.87 
 
 		 764 aa  302  2e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.88 
 
 		 732 aa  300  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.02 
 
 		 721 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  30.16 
 
 		 738 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  31.54 
 
 		 753 aa  276  7e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  32.36 
 
 		 757 aa  267  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 		 804 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 		 804 aa  263  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 		 773 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 		 777 aa  262  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 		 777 aa  259  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  31.05 
 
 		 804 aa  259  9e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.05 
 
 		 849 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 		 671 aa  236  9e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.76 
 
 		 738 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  27.74 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  27.14 
 
 		 769 aa  210  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  33.8 
 
 		 768 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.72 
 
 		 747 aa  203  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  29.52 
 
 		 679 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  26.38 
 
 		 754 aa  194  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  26.44 
 
 		 749 aa  194  5e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  26.48 
 
 		 752 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  26.48 
 
 		 752 aa  194  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  32 
 
 		 769 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  26.72 
 
 		 753 aa  190  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 1409 aa  190  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.73 
 
 		 904 aa  188  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  28.77 
 
 		 745 aa  187  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.67 
 
 		 688 aa  187  8e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.02 
 
 		 692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 		 891 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 		 1232 aa  181  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  27.73 
 
 		 752 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 		 1257 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 698 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.02 
 
 		 722 aa  178  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.55 
 
 		 900 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 		 1338 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 		 752 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 		 752 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  28.6 
 
 		 752 aa  177  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0773  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 		 1407 aa  176  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.32 
 
 		 893 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 		 762 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 755 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.47 
 
 		 766 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 		 1341 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 		 709 aa  172  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.96 
 
 		 679 aa  172  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.49 
 
 		 893 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 		 758 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 		 1357 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.8 
 
 		 689 aa  170  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  25.36 
 
 		 1383 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  25.73 
 
 		 1139 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.97 
 
 		 668 aa  168  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25.84 
 
 		 685 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 		 714 aa  167  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.52 
 
 		 674 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  27.69 
 
 		 908 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 715 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>