More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_18640 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  76.78 
 
 		 702 aa  1087    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  76.06 
 
 		 732 aa  1104    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  77.64 
 
 		 702 aa  1133    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  82.76 
 
 		 702 aa  1195    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  48.13 
 
 		 773 aa  649    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  79.2 
 
 		 701 aa  1158    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  47.95 
 
 		 729 aa  690    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  75.36 
 
 		 702 aa  1082    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  50.35 
 
 		 731 aa  650    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  76.92 
 
 		 702 aa  1091    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  97.29 
 
 		 702 aa  1394    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  53.33 
 
 		 691 aa  757    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  48.52 
 
 		 741 aa  711    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  47.98 
 
 		 726 aa  685    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  48.27 
 
 		 717 aa  669    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  46.53 
 
 		 704 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  100 
 
 		 702 aa  1422    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  46.04 
 
 		 1299 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  45.71 
 
 		 713 aa  638    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  76.64 
 
 		 702 aa  1088    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  49.8 
 
 		 764 aa  703    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  49.01 
 
 		 747 aa  624  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  47.51 
 
 		 687 aa  621  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  46.03 
 
 		 738 aa  597  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.66 
 
 		 732 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.95 
 
 		 739 aa  581  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.72 
 
 		 721 aa  570  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  44.47 
 
 		 739 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  43.99 
 
 		 739 aa  520  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.92 
 
 		 733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  40.45 
 
 		 753 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  40.8 
 
 		 757 aa  481  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  39.94 
 
 		 725 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  39.64 
 
 		 733 aa  439  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  39.29 
 
 		 743 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  39.56 
 
 		 715 aa  428  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  34.92 
 
 		 727 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  35.37 
 
 		 726 aa  378  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  44.63 
 
 		 768 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  35.21 
 
 		 721 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  35.21 
 
 		 721 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  35.07 
 
 		 721 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  34.29 
 
 		 720 aa  353  7e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  33.92 
 
 		 720 aa  348  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.35 
 
 		 738 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  28.9 
 
 		 671 aa  219  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.04 
 
 		 769 aa  197  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  29.13 
 
 		 749 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  29.2 
 
 		 679 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.04 
 
 		 773 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.04 
 
 		 849 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  31.04 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.04 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  31.04 
 
 		 804 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.04 
 
 		 804 aa  191  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.04 
 
 		 804 aa  191  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  28.11 
 
 		 698 aa  190  9e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.11 
 
 		 757 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  29.52 
 
 		 769 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.4 
 
 		 668 aa  181  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  29.18 
 
 		 752 aa  180  9e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  29.18 
 
 		 752 aa  180  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  28.98 
 
 		 752 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  29.39 
 
 		 753 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.69 
 
 		 917 aa  177  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 700 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  28.78 
 
 		 754 aa  175  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.51 
 
 		 722 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.53 
 
 		 893 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 		 688 aa  173  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  28 
 
 		 739 aa  170  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.44 
 
 		 692 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 		 692 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.47 
 
 		 835 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.98 
 
 		 679 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.35 
 
 		 927 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  29.5 
 
 		 747 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2676  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 		 715 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  24.76 
 
 		 1135 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 		 695 aa  165  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  29.75 
 
 		 746 aa  164  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.11 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  25.62 
 
 		 732 aa  161  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.35 
 
 		 886 aa  162  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 		 729 aa  161  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 		 726 aa  161  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.36 
 
 		 808 aa  160  9e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 		 726 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  28.35 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.75 
 
 		 907 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 		 708 aa  159  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 		 684 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 706 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 		 729 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.67 
 
 		 724 aa  158  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.48 
 
 		 898 aa  157  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  26.81 
 
 		 709 aa  157  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.14 
 
 		 766 aa  156  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.58 
 
 		 723 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  25.82 
 
 		 692 aa  156  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>