More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2648 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  45.38 
 
 		 746 aa  672    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 747 aa  1547    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  45.26 
 
 		 835 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.03 
 
 		 773 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.16 
 
 		 804 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.16 
 
 		 804 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.03 
 
 		 777 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  34.03 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  33.9 
 
 		 777 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  34.03 
 
 		 849 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.55 
 
 		 769 aa  412  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  34.76 
 
 		 769 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  33.29 
 
 		 749 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  33.38 
 
 		 754 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  33.82 
 
 		 753 aa  368  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  32.76 
 
 		 752 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  32.76 
 
 		 752 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  32.76 
 
 		 752 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.46 
 
 		 757 aa  360  4e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  26.46 
 
 		 721 aa  222  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  26.32 
 
 		 721 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  26.32 
 
 		 721 aa  221  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 		 725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 		 738 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  27 
 
 		 739 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  24.6 
 
 		 713 aa  204  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.82 
 
 		 739 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  26.54 
 
 		 720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  27.98 
 
 		 753 aa  200  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  25.49 
 
 		 733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 		 743 aa  197  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  30.58 
 
 		 691 aa  195  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  25.46 
 
 		 720 aa  195  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  25.53 
 
 		 715 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  24.97 
 
 		 729 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.22 
 
 		 733 aa  187  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  25.23 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.49 
 
 		 773 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  31.14 
 
 		 687 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  26.37 
 
 		 738 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 		 717 aa  185  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  26.46 
 
 		 747 aa  184  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  25.32 
 
 		 727 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  31.01 
 
 		 702 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  30.21 
 
 		 729 aa  181  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  26.32 
 
 		 757 aa  180  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 		 704 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 		 711 aa  177  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.92 
 
 		 657 aa  176  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  29.5 
 
 		 702 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  29.12 
 
 		 701 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.88 
 
 		 722 aa  172  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  29.05 
 
 		 702 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.52 
 
 		 732 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  26.79 
 
 		 741 aa  171  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  29.5 
 
 		 702 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  28.83 
 
 		 702 aa  170  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  25.2 
 
 		 739 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  25.59 
 
 		 702 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  29.05 
 
 		 702 aa  167  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 		 671 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  28.54 
 
 		 732 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 		 731 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 		 726 aa  163  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  26.53 
 
 		 1299 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.3 
 
 		 745 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 		 673 aa  161  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  23.66 
 
 		 1139 aa  160  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.48 
 
 		 721 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 		 1055 aa  158  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  23.17 
 
 		 1143 aa  159  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  28.38 
 
 		 702 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  26.19 
 
 		 726 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  28.18 
 
 		 899 aa  157  8e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 		 791 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.88 
 
 		 698 aa  156  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.69 
 
 		 657 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 		 891 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.27 
 
 		 668 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  29.4 
 
 		 768 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28 
 
 		 747 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.08 
 
 		 744 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.46 
 
 		 726 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 		 726 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 		 662 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.97 
 
 		 688 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.25 
 
 		 726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.96 
 
 		 917 aa  148  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  25 
 
 		 752 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 662 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 700 aa  145  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.48 
 
 		 718 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  29.36 
 
 		 731 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 		 1171 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 		 718 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 		 718 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 		 708 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.29 
 
 		 679 aa  144  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  23.58 
 
 		 685 aa  144  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>