More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2055 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  58.36 
 
 		 725 aa  809    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  98.91 
 
 		 743 aa  1462    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  100 
 
 		 715 aa  1432    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  51.86 
 
 		 727 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  100 
 
 		 733 aa  1474    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  51.17 
 
 		 726 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  37.93 
 
 		 717 aa  473  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  36.1 
 
 		 729 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  40.83 
 
 		 747 aa  465  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  37.6 
 
 		 691 aa  461  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  39.51 
 
 		 702 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  38.29 
 
 		 702 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  36.02 
 
 		 704 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  38.76 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  37.98 
 
 		 701 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  39.64 
 
 		 702 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  39.87 
 
 		 739 aa  452  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  36.24 
 
 		 1299 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  34.75 
 
 		 726 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  36.81 
 
 		 732 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.63 
 
 		 773 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  39 
 
 		 733 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  34.75 
 
 		 741 aa  438  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  37.72 
 
 		 702 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  35.92 
 
 		 764 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  37.23 
 
 		 687 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  33.51 
 
 		 713 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  37.48 
 
 		 739 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  36.99 
 
 		 702 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  36.42 
 
 		 738 aa  422  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  37.13 
 
 		 702 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  39.13 
 
 		 731 aa  418  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.62 
 
 		 732 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  36.96 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  38.21 
 
 		 757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.26 
 
 		 739 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  37.24 
 
 		 753 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.48 
 
 		 721 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  36.26 
 
 		 721 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  36.11 
 
 		 721 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  36.11 
 
 		 721 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  36.02 
 
 		 720 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  35.43 
 
 		 720 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 		 804 aa  298  3e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  29.97 
 
 		 777 aa  297  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.97 
 
 		 849 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.39 
 
 		 769 aa  296  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 804 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 804 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 773 aa  295  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 777 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  39.62 
 
 		 768 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  29.58 
 
 		 749 aa  268  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 		 671 aa  263  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  29.3 
 
 		 754 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  28.82 
 
 		 746 aa  254  3e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  28.16 
 
 		 752 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  28.16 
 
 		 752 aa  248  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  27.99 
 
 		 752 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.41 
 
 		 738 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  29.07 
 
 		 753 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  31.26 
 
 		 679 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  30.2 
 
 		 674 aa  224  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.15 
 
 		 679 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  32.08 
 
 		 769 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  30.56 
 
 		 693 aa  212  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  28.09 
 
 		 685 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 		 684 aa  211  6e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  27.42 
 
 		 692 aa  209  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.78 
 
 		 835 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 		 747 aa  203  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  30.27 
 
 		 703 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.93 
 
 		 698 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.43 
 
 		 685 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 		 891 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.73 
 
 		 698 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  30.41 
 
 		 697 aa  200  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 		 688 aa  197  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 		 673 aa  196  9e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.48 
 
 		 703 aa  196  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 		 718 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.3 
 
 		 757 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 		 718 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  27.72 
 
 		 674 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 		 718 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  28.24 
 
 		 698 aa  195  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 		 694 aa  194  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.36 
 
 		 893 aa  193  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 726 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 		 688 aa  191  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.84 
 
 		 701 aa  191  5e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 688 aa  190  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.21 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 		 708 aa  188  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.32 
 
 		 688 aa  187  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  27.3 
 
 		 727 aa  187  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.79 
 
 		 758 aa  187  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 		 726 aa  187  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.14 
 
 		 766 aa  187  7e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.93 
 
 		 758 aa  186  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>