More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2776 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 687 aa  1385    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  46.18 
 
 		 691 aa  633  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  47.52 
 
 		 702 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  48.86 
 
 		 702 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  47.37 
 
 		 702 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  47.51 
 
 		 702 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  47.44 
 
 		 702 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  48.71 
 
 		 702 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  46.92 
 
 		 702 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  44.57 
 
 		 741 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  46.57 
 
 		 732 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  48.58 
 
 		 702 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  46.58 
 
 		 701 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  43.07 
 
 		 729 aa  595  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  41.6 
 
 		 1299 aa  568  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  42.06 
 
 		 764 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  40.78 
 
 		 726 aa  548  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  43.26 
 
 		 713 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  41.21 
 
 		 717 aa  536  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  40.97 
 
 		 704 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  42.51 
 
 		 738 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.7 
 
 		 732 aa  513  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  41.87 
 
 		 747 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.84 
 
 		 721 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  43.75 
 
 		 731 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.36 
 
 		 739 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  39.56 
 
 		 773 aa  490  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  40.56 
 
 		 739 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  41.16 
 
 		 739 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  39.76 
 
 		 753 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.7 
 
 		 733 aa  439  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  37.43 
 
 		 757 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  37.09 
 
 		 743 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  37.23 
 
 		 733 aa  412  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  37.08 
 
 		 715 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  37.34 
 
 		 725 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  36.44 
 
 		 726 aa  346  8.999999999999999e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  45.62 
 
 		 768 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  32.96 
 
 		 727 aa  340  4e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  34.21 
 
 		 721 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  34.21 
 
 		 721 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  33.94 
 
 		 721 aa  336  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  33.01 
 
 		 720 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.78 
 
 		 720 aa  313  5.999999999999999e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.74 
 
 		 671 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.22 
 
 		 769 aa  204  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 773 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  31.05 
 
 		 679 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 849 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 		 804 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 777 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  31.75 
 
 		 777 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 804 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.75 
 
 		 804 aa  201  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.17 
 
 		 738 aa  193  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  30.88 
 
 		 747 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  30.99 
 
 		 753 aa  179  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  31.44 
 
 		 746 aa  177  7e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.64 
 
 		 668 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.55 
 
 		 732 aa  172  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.67 
 
 		 835 aa  170  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  30 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 		 698 aa  164  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.63 
 
 		 757 aa  163  9e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  28.82 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  30.04 
 
 		 754 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 		 688 aa  161  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  25.15 
 
 		 687 aa  160  8e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  26.67 
 
 		 907 aa  160  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  26.91 
 
 		 957 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.22 
 
 		 657 aa  159  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 697 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.16 
 
 		 722 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2680  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 		 933 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.76 
 
 		 700 aa  157  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.92 
 
 		 960 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.92 
 
 		 960 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  29.01 
 
 		 752 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  29.01 
 
 		 752 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  29.01 
 
 		 752 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.92 
 
 		 960 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.12 
 
 		 729 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 		 703 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 		 762 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.97 
 
 		 688 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3417  Nitrate reductase  27.22 
 
 		 895 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 		 891 aa  151  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  25.08 
 
 		 689 aa  151  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.79 
 
 		 959 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2319  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.96 
 
 		 929 aa  150  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00502256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  24.32 
 
 		 708 aa  150  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 		 695 aa  150  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.76 
 
 		 983 aa  150  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.77 
 
 		 685 aa  150  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 		 1171 aa  150  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.04 
 
 		 979 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  26.87 
 
 		 884 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.68 
 
 		 698 aa  148  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  25.07 
 
 		 731 aa  147  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0923  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 		 621 aa  147  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000228459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>