More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1413 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 739 aa  1459    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  59.92 
 
 		 721 aa  805    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  48.97 
 
 		 773 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  56.78 
 
 		 732 aa  794    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  50.95 
 
 		 738 aa  677    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  56.42 
 
 		 747 aa  739    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  59.19 
 
 		 739 aa  808    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  86.33 
 
 		 739 aa  1268    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  51.8 
 
 		 768 aa  634  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  44.93 
 
 		 764 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  41.53 
 
 		 704 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  43.03 
 
 		 691 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  45.88 
 
 		 753 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  42.55 
 
 		 701 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  40.56 
 
 		 713 aa  556  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  40.24 
 
 		 717 aa  558  1e-157  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  40.5 
 
 		 729 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  42.53 
 
 		 702 aa  549  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  45.15 
 
 		 757 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  43.86 
 
 		 702 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  42.11 
 
 		 732 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  42.93 
 
 		 702 aa  547  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  43.99 
 
 		 702 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  39.11 
 
 		 1299 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  42.97 
 
 		 702 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  42.9 
 
 		 702 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  42.9 
 
 		 702 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  42.9 
 
 		 702 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  43.67 
 
 		 731 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  39.84 
 
 		 741 aa  532  1e-149  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  38.02 
 
 		 726 aa  528  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  41.16 
 
 		 687 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.98 
 
 		 733 aa  490  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  38.81 
 
 		 725 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  37.48 
 
 		 733 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  37.35 
 
 		 743 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  37.04 
 
 		 726 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  37.65 
 
 		 715 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  35.8 
 
 		 727 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  34.92 
 
 		 721 aa  353  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  34.92 
 
 		 721 aa  353  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  34.92 
 
 		 721 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.63 
 
 		 720 aa  313  9e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  33.25 
 
 		 720 aa  310  8e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.27 
 
 		 671 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  27.92 
 
 		 746 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  32.42 
 
 		 738 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28 
 
 		 749 aa  196  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  32.28 
 
 		 679 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.31 
 
 		 688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.69 
 
 		 933 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  31 
 
 		 757 aa  185  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 		 698 aa  183  8.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.96 
 
 		 937 aa  183  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.84 
 
 		 668 aa  180  9e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 		 691 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.73 
 
 		 929 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.31 
 
 		 945 aa  177  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0131  molybdopterin oxidoreductase  31.83 
 
 		 788 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.77296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.96 
 
 		 989 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  28.21 
 
 		 691 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.3 
 
 		 747 aa  174  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.74 
 
 		 989 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  29.74 
 
 		 769 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.98 
 
 		 691 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.03 
 
 		 900 aa  173  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.64 
 
 		 676 aa  173  1e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 691 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.98 
 
 		 691 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  28.38 
 
 		 753 aa  172  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.74 
 
 		 927 aa  172  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.58 
 
 		 674 aa  171  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.96 
 
 		 988 aa  171  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.19 
 
 		 676 aa  171  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.88 
 
 		 989 aa  171  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.31 
 
 		 989 aa  171  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.45 
 
 		 691 aa  170  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.42 
 
 		 676 aa  170  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.6 
 
 		 904 aa  170  8e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 		 691 aa  170  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.14 
 
 		 924 aa  170  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.22 
 
 		 917 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.17 
 
 		 963 aa  169  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.81 
 
 		 925 aa  169  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.3 
 
 		 777 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  31 
 
 		 654 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.3 
 
 		 773 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.3 
 
 		 804 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.78 
 
 		 961 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 804 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.3 
 
 		 804 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 777 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.3 
 
 		 849 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.94 
 
 		 677 aa  168  4e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.03 
 
 		 674 aa  167  5e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.57 
 
 		 724 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.94 
 
 		 924 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.3 
 
 		 769 aa  167  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  27.32 
 
 		 752 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 		 759 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>