More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2925 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  52.84 
 
 		 702 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  53.24 
 
 		 732 aa  742    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  54.24 
 
 		 702 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  52.41 
 
 		 701 aa  737    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  53.27 
 
 		 702 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  46.88 
 
 		 713 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 691 aa  1416    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  46.17 
 
 		 773 aa  647    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  49.29 
 
 		 731 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  50.07 
 
 		 741 aa  753    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  47.28 
 
 		 764 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  47.03 
 
 		 729 aa  727    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  46.93 
 
 		 726 aa  721    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  52.98 
 
 		 702 aa  729    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  52.62 
 
 		 702 aa  750    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  47.63 
 
 		 739 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  45.86 
 
 		 747 aa  639    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  48.64 
 
 		 704 aa  682    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  53.33 
 
 		 702 aa  757    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  52.98 
 
 		 702 aa  750    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  52.98 
 
 		 702 aa  740    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  45.98 
 
 		 717 aa  678    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  48.04 
 
 		 1299 aa  724    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  46.18 
 
 		 687 aa  633  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.97 
 
 		 732 aa  617  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  45.82 
 
 		 738 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.83 
 
 		 721 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  43.03 
 
 		 739 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  41.82 
 
 		 757 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  42.98 
 
 		 733 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  43.03 
 
 		 739 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  40.45 
 
 		 753 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  37.97 
 
 		 725 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  37.6 
 
 		 733 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  37.19 
 
 		 743 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  37.5 
 
 		 715 aa  437  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  34.44 
 
 		 727 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  34.6 
 
 		 726 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  44.79 
 
 		 768 aa  385  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  33.98 
 
 		 720 aa  369  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  33.38 
 
 		 721 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  33.38 
 
 		 721 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  33.1 
 
 		 721 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  32.32 
 
 		 720 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.45 
 
 		 671 aa  254  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  30.23 
 
 		 679 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  27.87 
 
 		 738 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  26.53 
 
 		 746 aa  212  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.02 
 
 		 769 aa  204  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.94 
 
 		 676 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 		 804 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.96 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.96 
 
 		 804 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.96 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.96 
 
 		 773 aa  198  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.66 
 
 		 676 aa  198  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.66 
 
 		 676 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.96 
 
 		 849 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  32.13 
 
 		 753 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  29.91 
 
 		 747 aa  190  9e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  30.37 
 
 		 769 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  28.65 
 
 		 752 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  25.59 
 
 		 1135 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  28.22 
 
 		 835 aa  188  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  31.8 
 
 		 749 aa  188  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  28.65 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  28.65 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 		 666 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  29.47 
 
 		 745 aa  186  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 		 700 aa  186  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  23.6 
 
 		 685 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.52 
 
 		 927 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 739 aa  180  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  30.2 
 
 		 754 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  26.46 
 
 		 958 aa  178  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.92 
 
 		 688 aa  178  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 		 756 aa  177  5e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 		 739 aa  177  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  24.28 
 
 		 747 aa  177  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 		 731 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.83 
 
 		 886 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.67 
 
 		 893 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.69 
 
 		 689 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.83 
 
 		 886 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.03 
 
 		 907 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 		 673 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.71 
 
 		 679 aa  176  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 		 695 aa  175  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.32 
 
 		 692 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  27.32 
 
 		 667 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.25 
 
 		 668 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23350  assimilatory nitrate reductase, NasB  26.78 
 
 		 901 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.29 
 
 		 886 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.29 
 
 		 886 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.1 
 
 		 711 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.24 
 
 		 808 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.38 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  24.69 
 
 		 698 aa  172  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  26.11 
 
 		 729 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>