More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2859 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  56.64 
 
 		 715 aa  851    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.64 
 
 		 715 aa  851    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.25 
 
 		 716 aa  930    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  58.28 
 
 		 715 aa  882    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  56.78 
 
 		 715 aa  855    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  67.12 
 
 		 737 aa  1061    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.69 
 
 		 716 aa  922    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  55.95 
 
 		 559 aa  649    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.13 
 
 		 716 aa  920    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  56.94 
 
 		 716 aa  879    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  57.96 
 
 		 713 aa  887    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.78 
 
 		 715 aa  855    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  58.28 
 
 		 715 aa  882    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.02 
 
 		 723 aa  894    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.25 
 
 		 716 aa  924    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 808 aa  1664    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  56.78 
 
 		 715 aa  855    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  56.64 
 
 		 715 aa  851    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  55.46 
 
 		 559 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.14 
 
 		 715 aa  881    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.33 
 
 		 718 aa  887    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  42.16 
 
 		 745 aa  561  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.81 
 
 		 917 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.42 
 
 		 901 aa  513  1e-144  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.94 
 
 		 893 aa  512  1e-144  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 893 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.75 
 
 		 879 aa  506  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 		 893 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 		 905 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.13 
 
 		 677 aa  504  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  39.66 
 
 		 899 aa  502  1e-140  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.29 
 
 		 900 aa  501  1e-140  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 900 aa  497  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 		 676 aa  496  1e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 		 676 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.22 
 
 		 674 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 		 676 aa  494  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.66 
 
 		 906 aa  494  9.999999999999999e-139  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 		 674 aa  490  1e-137  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.07 
 
 		 674 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.36 
 
 		 674 aa  491  1e-137  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.17 
 
 		 688 aa  483  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.93 
 
 		 688 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 687 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.93 
 
 		 925 aa  481  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.66 
 
 		 920 aa  478  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.52 
 
 		 945 aa  476  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.46 
 
 		 929 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.6 
 
 		 904 aa  475  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.04 
 
 		 937 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  37.02 
 
 		 695 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.71 
 
 		 898 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 		 689 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.69 
 
 		 688 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.13 
 
 		 988 aa  465  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.13 
 
 		 988 aa  465  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.31 
 
 		 686 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 		 911 aa  460  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  37.71 
 
 		 909 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.63 
 
 		 1440 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.64 
 
 		 688 aa  456  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 		 903 aa  458  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.99 
 
 		 1111 aa  458  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.98 
 
 		 1410 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  36.47 
 
 		 687 aa  458  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.26 
 
 		 989 aa  458  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.74 
 
 		 956 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.32 
 
 		 988 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 724 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  37.63 
 
 		 1387 aa  451  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.87 
 
 		 689 aa  451  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.93 
 
 		 686 aa  450  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.36 
 
 		 754 aa  451  1e-125  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.69 
 
 		 1426 aa  452  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  36.33 
 
 		 957 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.98 
 
 		 989 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.29 
 
 		 1110 aa  448  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.48 
 
 		 947 aa  444  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 		 967 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.39 
 
 		 963 aa  446  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  36.73 
 
 		 1385 aa  445  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.99 
 
 		 989 aa  443  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.13 
 
 		 989 aa  444  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.93 
 
 		 924 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 927 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.43 
 
 		 1406 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.74 
 
 		 1421 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.95 
 
 		 1440 aa  444  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 		 983 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4072  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.96 
 
 		 957 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.5 
 
 		 1130 aa  442  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.32 
 
 		 1425 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.21 
 
 		 946 aa  438  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.16 
 
 		 956 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  36.85 
 
 		 1412 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 		 1425 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.25 
 
 		 685 aa  437  1e-121  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.4 
 
 		 983 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.95 
 
 		 924 aa  436  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>