More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1268 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  67.51 
 
 		 715 aa  1040    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.51 
 
 		 715 aa  1041    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.17 
 
 		 718 aa  1104    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  73.11 
 
 		 715 aa  1123    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  67.65 
 
 		 715 aa  1043    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  65.77 
 
 		 559 aa  788    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.25 
 
 		 808 aa  930    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  67.51 
 
 		 715 aa  1040    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  67.65 
 
 		 715 aa  1043    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  74.44 
 
 		 713 aa  1133    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  66.49 
 
 		 559 aa  794    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 716 aa  1493    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  95.67 
 
 		 716 aa  1442    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  72.83 
 
 		 715 aa  1117    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  76.27 
 
 		 723 aa  1148    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  86.12 
 
 		 716 aa  1310    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  72.97 
 
 		 715 aa  1122    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.65 
 
 		 715 aa  1043    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  69.01 
 
 		 716 aa  1061    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  59.3 
 
 		 737 aa  909    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  85.69 
 
 		 716 aa  1303    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  45.61 
 
 		 745 aa  631  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.07 
 
 		 677 aa  598  1e-169  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 		 674 aa  592  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.61 
 
 		 893 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.19 
 
 		 674 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.67 
 
 		 676 aa  591  1e-167  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.9 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.88 
 
 		 893 aa  586  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.6 
 
 		 676 aa  586  1e-166  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  43.25 
 
 		 899 aa  588  1e-166  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.9 
 
 		 674 aa  587  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.6 
 
 		 674 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.56 
 
 		 900 aa  581  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.78 
 
 		 917 aa  575  1.0000000000000001e-163  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.44 
 
 		 893 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.61 
 
 		 688 aa  570  1e-161  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.25 
 
 		 901 aa  566  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.13 
 
 		 904 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 		 687 aa  562  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.23 
 
 		 900 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  41.12 
 
 		 689 aa  561  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 		 688 aa  557  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.57 
 
 		 879 aa  556  1e-157  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.5 
 
 		 906 aa  558  1e-157  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.98 
 
 		 688 aa  556  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.67 
 
 		 905 aa  555  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.85 
 
 		 689 aa  553  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.79 
 
 		 898 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.16 
 
 		 724 aa  543  1e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  41.06 
 
 		 687 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  40.49 
 
 		 695 aa  536  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.63 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.36 
 
 		 686 aa  537  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.09 
 
 		 685 aa  532  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.43 
 
 		 945 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.87 
 
 		 685 aa  529  1e-149  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.22 
 
 		 920 aa  525  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 		 911 aa  518  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.33 
 
 		 903 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.91 
 
 		 937 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.94 
 
 		 1440 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.19 
 
 		 1406 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.68 
 
 		 983 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.15 
 
 		 983 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 983 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 983 aa  497  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 963 aa  494  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.98 
 
 		 925 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.31 
 
 		 1428 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.67 
 
 		 956 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.36 
 
 		 886 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.12 
 
 		 956 aa  493  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0895  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.3 
 
 		 983 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.99873  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  38 
 
 		 1410 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 		 983 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 1421 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.59 
 
 		 1425 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.75 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.31 
 
 		 952 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.02 
 
 		 944 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.63 
 
 		 1424 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.88 
 
 		 949 aa  488  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  45.75 
 
 		 526 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.74 
 
 		 947 aa  482  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.88 
 
 		 960 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.02 
 
 		 983 aa  485  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.61 
 
 		 1425 aa  484  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.89 
 
 		 1425 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.77 
 
 		 1432 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.77 
 
 		 1432 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.25 
 
 		 979 aa  481  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.09 
 
 		 960 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 		 950 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 		 946 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  37.04 
 
 		 957 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.52 
 
 		 948 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.48 
 
 		 1432 aa  479  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.45 
 
 		 979 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>