More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00920 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  56.47 
 
 
715 aa  843    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.47 
 
 
715 aa  843    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.04 
 
 
716 aa  887    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  56.61 
 
 
715 aa  846    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.3 
 
 
716 aa  909    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.22 
 
 
718 aa  863    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  55.94 
 
 
715 aa  853    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  57.26 
 
 
713 aa  885    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.3 
 
 
716 aa  909    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.61 
 
 
715 aa  846    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  56.47 
 
 
715 aa  843    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.93 
 
 
723 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  56.61 
 
 
715 aa  846    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.32 
 
 
716 aa  887    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  67.12 
 
 
808 aa  1061    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00920  formate dehydrogenase alpha subunit  100 
 
 
737 aa  1546    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.94 
 
 
715 aa  853    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  53.91 
 
 
716 aa  842    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  55.94 
 
 
715 aa  853    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4635  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  54.27 
 
 
559 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0281  formate dehydrogenase alpha subunit  53.39 
 
 
559 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  40.59 
 
 
745 aa  549  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.58 
 
 
893 aa  520  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.1 
 
 
677 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 
900 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.76 
 
 
674 aa  514  1e-144  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.9 
 
 
674 aa  515  1e-144  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.76 
 
 
674 aa  513  1e-144  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.84 
 
 
905 aa  514  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.74 
 
 
674 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.65 
 
 
893 aa  500  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 
879 aa  499  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.96 
 
 
901 aa  501  1e-140  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 
917 aa  497  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.28 
 
 
676 aa  489  1e-137  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.28 
 
 
676 aa  489  1e-136  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.9 
 
 
893 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.85 
 
 
676 aa  486  1e-136  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  39.02 
 
 
899 aa  486  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.59 
 
 
945 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.12 
 
 
688 aa  488  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.55 
 
 
906 aa  482  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.55 
 
 
904 aa  479  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.86 
 
 
911 aa  466  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.06 
 
 
903 aa  464  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.9 
 
 
689 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.88 
 
 
688 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.05 
 
 
724 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 
685 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 
925 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.08 
 
 
687 aa  457  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 
937 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.8 
 
 
688 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.93 
 
 
688 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.1 
 
 
686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.27 
 
 
900 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.5 
 
 
689 aa  451  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.92 
 
 
685 aa  452  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.5 
 
 
924 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.44 
 
 
920 aa  451  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.18 
 
 
989 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.91 
 
 
1428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0293  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.76 
 
 
989 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.2 
 
 
898 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  34.71 
 
 
687 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.81 
 
 
988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.81 
 
 
988 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.68 
 
 
1424 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.65 
 
 
754 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.53 
 
 
989 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  35.64 
 
 
695 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.58 
 
 
1440 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.53 
 
 
989 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1109  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.04 
 
 
963 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.612386  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.35 
 
 
1110 aa  439  9.999999999999999e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.9 
 
 
1421 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.04 
 
 
1111 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.91 
 
 
988 aa  439  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  36.61 
 
 
957 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.34 
 
 
1432 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.84 
 
 
686 aa  435  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  35.85 
 
 
1387 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.19 
 
 
959 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.05 
 
 
1432 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 
1432 aa  435  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.93 
 
 
947 aa  429  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.6 
 
 
946 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.19 
 
 
1425 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  33.48 
 
 
909 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.81 
 
 
956 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.29 
 
 
953 aa  430  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.83 
 
 
967 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 
1425 aa  428  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 
948 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.64 
 
 
1385 aa  428  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0552  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.85 
 
 
983 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.918724  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 
983 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.656443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.04 
 
 
1406 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.4 
 
 
983 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1031  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.85 
 
 
983 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.52357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>