More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4442 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  77.58 
 
 		 721 aa  1150    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 720 aa  1448    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  77.44 
 
 		 721 aa  1148    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  79.55 
 
 		 720 aa  1147    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  77.44 
 
 		 721 aa  1148    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  31.67 
 
 		 726 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  31.19 
 
 		 717 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  33.98 
 
 		 691 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  36.58 
 
 		 725 aa  363  4e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  36.02 
 
 		 733 aa  359  9e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  31.16 
 
 		 729 aa  358  2.9999999999999997e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  35.72 
 
 		 743 aa  355  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  34.19 
 
 		 702 aa  352  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  30.33 
 
 		 1299 aa  351  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  35.44 
 
 		 739 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  35.91 
 
 		 715 aa  348  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  33.92 
 
 		 702 aa  348  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  31.88 
 
 		 713 aa  346  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  32.83 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  33.79 
 
 		 702 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  33.15 
 
 		 732 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 		 701 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  36.46 
 
 		 731 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  32.03 
 
 		 764 aa  335  1e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  33.02 
 
 		 702 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.66 
 
 		 733 aa  324  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  30.24 
 
 		 741 aa  321  3e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  32.16 
 
 		 727 aa  321  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  32.74 
 
 		 702 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  32.29 
 
 		 702 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  32.11 
 
 		 702 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  28.57 
 
 		 704 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  32.78 
 
 		 687 aa  313  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  33.68 
 
 		 747 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  33.38 
 
 		 739 aa  310  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.56 
 
 		 732 aa  310  6.999999999999999e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  32.7 
 
 		 726 aa  306  8.000000000000001e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.95 
 
 		 773 aa  304  4.0000000000000003e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  32.36 
 
 		 739 aa  299  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  31.33 
 
 		 738 aa  290  8e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  32.76 
 
 		 753 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.47 
 
 		 721 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  32.27 
 
 		 757 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  30.15 
 
 		 671 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 804 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 804 aa  236  8e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 777 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.04 
 
 		 773 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 		 804 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  28.91 
 
 		 777 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.91 
 
 		 849 aa  233  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.61 
 
 		 769 aa  225  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  28.55 
 
 		 746 aa  224  3e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  31.1 
 
 		 679 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  29.97 
 
 		 738 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 747 aa  200  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1268  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 		 884 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 768 aa  199  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  27.95 
 
 		 745 aa  199  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.82 
 
 		 677 aa  192  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 		 698 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  25.63 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.95 
 
 		 900 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.97 
 
 		 668 aa  183  7e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  26.55 
 
 		 754 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.41 
 
 		 874 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.45 
 
 		 692 aa  183  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  27.15 
 
 		 1338 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.9 
 
 		 891 aa  182  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.2 
 
 		 674 aa  182  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  25.35 
 
 		 752 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  26.51 
 
 		 769 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  25.35 
 
 		 752 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.78 
 
 		 893 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.52 
 
 		 904 aa  181  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 		 673 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.07 
 
 		 674 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.38 
 
 		 674 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.77 
 
 		 766 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.23 
 
 		 674 aa  174  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.85 
 
 		 685 aa  173  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.21 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 1257 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1909  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 		 744 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 		 1357 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 		 1341 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 		 700 aa  170  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.8 
 
 		 729 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.15 
 
 		 879 aa  169  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41560  assimilatory nitrate reductase  27.14 
 
 		 908 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 		 691 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 		 1232 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 		 1055 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.46 
 
 		 722 aa  167  8e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  25.32 
 
 		 899 aa  167  9e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 		 1409 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0616  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 		 755 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.241812  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.21 
 
 		 920 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3527  assimilatory nitrate reductase  25.92 
 
 		 906 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  26.25 
 
 		 711 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>