More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4342 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  51.58 
 
 		 743 aa  686    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  51.47 
 
 		 715 aa  664    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 727 aa  1486    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  52.9 
 
 		 725 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  51.86 
 
 		 733 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  81.36 
 
 		 726 aa  1171    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  39.36 
 
 		 747 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  35.8 
 
 		 764 aa  449  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  36.57 
 
 		 717 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  36.68 
 
 		 702 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  37.77 
 
 		 701 aa  432  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  37.2 
 
 		 739 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  36.63 
 
 		 702 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  33.2 
 
 		 726 aa  422  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  34.58 
 
 		 691 aa  421  1e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  35.95 
 
 		 732 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  35.54 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  33.29 
 
 		 729 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  35.2 
 
 		 702 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  37.93 
 
 		 731 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  33.29 
 
 		 1299 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  34.55 
 
 		 702 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.91 
 
 		 739 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  32.41 
 
 		 704 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  35.94 
 
 		 739 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.83 
 
 		 773 aa  398  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  34.68 
 
 		 702 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  33.91 
 
 		 738 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  34.41 
 
 		 702 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  34.55 
 
 		 702 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  32.32 
 
 		 713 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  37.21 
 
 		 733 aa  382  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  32.24 
 
 		 741 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.51 
 
 		 732 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  34.21 
 
 		 753 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  34.71 
 
 		 757 aa  360  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  33.1 
 
 		 687 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.27 
 
 		 721 aa  339  9e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  32.43 
 
 		 720 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  31.58 
 
 		 721 aa  326  8.000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  31.43 
 
 		 721 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  31.43 
 
 		 721 aa  324  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  31.58 
 
 		 720 aa  318  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  41.2 
 
 		 768 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  28.18 
 
 		 746 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.93 
 
 		 769 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  29.85 
 
 		 679 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 773 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.72 
 
 		 849 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 804 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.24 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  27.24 
 
 		 777 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  28.63 
 
 		 835 aa  201  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 671 aa  201  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.84 
 
 		 1135 aa  195  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  26.94 
 
 		 1139 aa  194  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 		 747 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 		 698 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.77 
 
 		 744 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 		 747 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  26.46 
 
 		 1143 aa  184  7e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 		 936 aa  180  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.78 
 
 		 749 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  26.37 
 
 		 745 aa  176  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  29.66 
 
 		 769 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  25.07 
 
 		 738 aa  174  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.39 
 
 		 688 aa  172  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  25.4 
 
 		 731 aa  172  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  26.95 
 
 		 749 aa  171  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 718 aa  171  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 		 726 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 718 aa  171  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.32 
 
 		 745 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 		 718 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.16 
 
 		 757 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 726 aa  169  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  26.14 
 
 		 752 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.02 
 
 		 668 aa  167  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.99 
 
 		 917 aa  167  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.78 
 
 		 676 aa  167  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.43 
 
 		 937 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  24.51 
 
 		 685 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  28.44 
 
 		 654 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.78 
 
 		 676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 		 726 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.78 
 
 		 676 aa  164  7e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  26.01 
 
 		 752 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  26.01 
 
 		 752 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  24.63 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  28.54 
 
 		 753 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.21 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 		 690 aa  162  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 893 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  25.64 
 
 		 708 aa  161  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.28 
 
 		 945 aa  161  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  28.75 
 
 		 754 aa  161  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>