More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2997 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  53.32 
 
 
749 aa  708    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  55.54 
 
 
752 aa  731    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  53.14 
 
 
769 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  53.82 
 
 
753 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  55.27 
 
 
752 aa  726    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  55.54 
 
 
752 aa  731    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  55.3 
 
 
754 aa  717    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
757 aa  1524    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.65 
 
 
773 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.78 
 
 
804 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.78 
 
 
804 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.65 
 
 
777 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
777 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.52 
 
 
849 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
804 aa  535  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  43.99 
 
 
769 aa  526  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  34.87 
 
 
746 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  33.86 
 
 
747 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  35.45 
 
 
835 aa  318  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  30.35 
 
 
743 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  30.35 
 
 
733 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  29.79 
 
 
702 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  30.46 
 
 
747 aa  240  8e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  30.33 
 
 
715 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  36.05 
 
 
725 aa  234  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  29 
 
 
732 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.88 
 
 
773 aa  228  3e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  30.07 
 
 
702 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  29.99 
 
 
702 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  30 
 
 
702 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  31.99 
 
 
739 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 
717 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  32.57 
 
 
701 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  31.1 
 
 
739 aa  220  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  30.76 
 
 
739 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  32.11 
 
 
702 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  33.4 
 
 
702 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  32.32 
 
 
702 aa  214  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.35 
 
 
733 aa  212  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  29.68 
 
 
687 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 
726 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  28.04 
 
 
727 aa  206  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  29.75 
 
 
738 aa  205  3e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  26.01 
 
 
729 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  31.47 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  27.68 
 
 
721 aa  200  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  27.54 
 
 
721 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  27.54 
 
 
721 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.77 
 
 
732 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.3 
 
 
692 aa  194  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  26.12 
 
 
713 aa  193  8e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  26.48 
 
 
720 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  28.55 
 
 
753 aa  184  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  27.8 
 
 
691 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  26.46 
 
 
720 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  28.79 
 
 
764 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.96 
 
 
721 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
704 aa  179  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  28.38 
 
 
1299 aa  178  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 
768 aa  177  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  27.96 
 
 
741 aa  177  9e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  27.12 
 
 
726 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  28.63 
 
 
738 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.68 
 
 
671 aa  164  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 
927 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 
668 aa  160  8e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.71 
 
 
685 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.81 
 
 
874 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.72 
 
 
917 aa  158  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  31.36 
 
 
693 aa  157  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  30.49 
 
 
731 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 
1405 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  26.8 
 
 
1228 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.4 
 
 
673 aa  155  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  27.57 
 
 
757 aa  154  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  29.52 
 
 
708 aa  154  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1752  molybdopterin oxidoreductase  28.54 
 
 
897 aa  154  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0232031 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.5 
 
 
722 aa  153  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.6 
 
 
985 aa  152  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3054  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 
741 aa  151  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0368144  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 
718 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 
718 aa  150  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.66 
 
 
676 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  30 
 
 
745 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 
718 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  28.73 
 
 
679 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.34 
 
 
676 aa  147  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.15 
 
 
674 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3992  molybdopterin oxidoreductase  45.55 
 
 
197 aa  146  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.37 
 
 
677 aa  146  1e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.89 
 
 
979 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  28.81 
 
 
706 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.91 
 
 
961 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3470  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.94 
 
 
963 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.873157  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.72 
 
 
657 aa  145  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.29 
 
 
674 aa  144  7e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  26.54 
 
 
1135 aa  144  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.11 
 
 
924 aa  144  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0814  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.59 
 
 
907 aa  143  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000793211  hitchhiker  0.00060648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.29 
 
 
674 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>