More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5802 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  51.27 
 
 		 721 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  52.6 
 
 		 739 aa  655    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  54.41 
 
 		 739 aa  682    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  52.9 
 
 		 747 aa  645    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  48.73 
 
 		 732 aa  645    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 768 aa  1503    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  53.07 
 
 		 739 aa  683    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  45.15 
 
 		 738 aa  557  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  45.11 
 
 		 773 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  44.79 
 
 		 757 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  45.05 
 
 		 753 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  46.67 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  43.53 
 
 		 713 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  47.64 
 
 		 702 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  47.02 
 
 		 702 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  46.07 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  47.02 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  46.49 
 
 		 702 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  46.61 
 
 		 702 aa  415  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  45.79 
 
 		 702 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  44.42 
 
 		 717 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  45.72 
 
 		 764 aa  412  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  44.42 
 
 		 702 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  45.34 
 
 		 701 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  43.63 
 
 		 704 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  44.03 
 
 		 732 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  50 
 
 		 731 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  41.44 
 
 		 741 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  44.19 
 
 		 687 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  40.99 
 
 		 1299 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  43.67 
 
 		 729 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  41.34 
 
 		 726 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  45.56 
 
 		 725 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  44.12 
 
 		 733 aa  331  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  41.09 
 
 		 743 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  41.34 
 
 		 727 aa  299  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  40.67 
 
 		 733 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  43.06 
 
 		 726 aa  299  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  40.64 
 
 		 715 aa  289  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  34.84 
 
 		 721 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  34.84 
 
 		 721 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  34.43 
 
 		 721 aa  233  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  34.85 
 
 		 720 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  34.85 
 
 		 720 aa  226  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  31.68 
 
 		 671 aa  210  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  31.38 
 
 		 749 aa  185  3e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  31.39 
 
 		 738 aa  184  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  31.91 
 
 		 753 aa  180  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  35.4 
 
 		 714 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  32.48 
 
 		 679 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  26.99 
 
 		 746 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  31.02 
 
 		 747 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  29.59 
 
 		 769 aa  174  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.95 
 
 		 757 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.57 
 
 		 676 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.18 
 
 		 676 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.25 
 
 		 769 aa  169  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.98 
 
 		 668 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.73 
 
 		 676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  34.46 
 
 		 715 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  26.95 
 
 		 835 aa  165  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.42 
 
 		 773 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.42 
 
 		 777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.42 
 
 		 804 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.42 
 
 		 804 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  29.42 
 
 		 777 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  29.42 
 
 		 804 aa  164  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.42 
 
 		 849 aa  164  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 		 988 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.25 
 
 		 988 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.31 
 
 		 685 aa  162  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  31.01 
 
 		 754 aa  163  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  30.83 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6354  putative formate dehydrogenase alpha subunit  30.93 
 
 		 909 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  32.48 
 
 		 759 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.41 
 
 		 927 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  30.83 
 
 		 752 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  30.83 
 
 		 752 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.05 
 
 		 726 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.05 
 
 		 677 aa  159  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3266  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.61 
 
 		 988 aa  159  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.271284  normal  0.20027 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3054  molybdopterin oxidoreductase  34.13 
 
 		 883 aa  157  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.033668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  27.7 
 
 		 899 aa  157  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  30.43 
 
 		 731 aa  157  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  29.46 
 
 		 732 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  29 
 
 		 745 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  29.3 
 
 		 739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 		 760 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.87 
 
 		 929 aa  154  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 684 aa  154  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  32.48 
 
 		 752 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.85 
 
 		 917 aa  152  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.46 
 
 		 674 aa  152  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.07 
 
 		 688 aa  152  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.82 
 
 		 766 aa  152  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2859  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.59 
 
 		 808 aa  151  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.960143 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 807 aa  151  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  30.58 
 
 		 706 aa  151  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0350  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  33.41 
 
 		 680 aa  151  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.11041  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0908  periplasmic nitrate reductase subunit NapA apoprotein  32.48 
 
 		 752 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>