More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2236 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  45.76 
 
 		 702 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  46.97 
 
 		 732 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  47.08 
 
 		 702 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  65.8 
 
 		 729 aa  1016    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  47.63 
 
 		 701 aa  692    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  46.93 
 
 		 691 aa  721    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  47.15 
 
 		 702 aa  679    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  43.58 
 
 		 1299 aa  646    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  44.14 
 
 		 702 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  51.44 
 
 		 741 aa  789    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  45.76 
 
 		 702 aa  657    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  100 
 
 		 726 aa  1518    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  43.13 
 
 		 717 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  48.12 
 
 		 702 aa  691    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  44.83 
 
 		 704 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  47.98 
 
 		 702 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  45.62 
 
 		 702 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  46.04 
 
 		 764 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  41.59 
 
 		 713 aa  600  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  41.59 
 
 		 747 aa  592  1e-168  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  41.01 
 
 		 773 aa  594  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  41.4 
 
 		 731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.27 
 
 		 739 aa  551  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  40.78 
 
 		 687 aa  548  1e-154  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.34 
 
 		 732 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  38 
 
 		 738 aa  530  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.35 
 
 		 721 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  38.62 
 
 		 739 aa  523  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.92 
 
 		 733 aa  513  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  38.15 
 
 		 739 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  35.81 
 
 		 753 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 725 aa  438  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  33.38 
 
 		 757 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  34.75 
 
 		 733 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  34.62 
 
 		 743 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  34.65 
 
 		 715 aa  415  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  33.15 
 
 		 727 aa  403  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  33.11 
 
 		 726 aa  393  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  31.67 
 
 		 720 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  31.66 
 
 		 721 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  31.8 
 
 		 721 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  31.8 
 
 		 721 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  31.67 
 
 		 720 aa  359  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  39.91 
 
 		 768 aa  332  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.71 
 
 		 773 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.71 
 
 		 777 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.71 
 
 		 804 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.71 
 
 		 804 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 		 804 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  25.71 
 
 		 777 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.71 
 
 		 849 aa  235  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 		 671 aa  223  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  26.28 
 
 		 738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.45 
 
 		 769 aa  207  8e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  23.97 
 
 		 746 aa  197  6e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  25.37 
 
 		 679 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.52 
 
 		 688 aa  189  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  28.23 
 
 		 769 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2334  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 		 716 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 		 695 aa  184  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1746  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.64 
 
 		 704 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.647009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  27.99 
 
 		 753 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  25.46 
 
 		 706 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  24.93 
 
 		 745 aa  181  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.07 
 
 		 917 aa  180  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  28.82 
 
 		 749 aa  178  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  23.74 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.38 
 
 		 893 aa  177  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  25.52 
 
 		 835 aa  177  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  22.74 
 
 		 685 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  26.94 
 
 		 754 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 		 756 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.32 
 
 		 724 aa  172  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  25.24 
 
 		 958 aa  172  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  28.64 
 
 		 752 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  28.64 
 
 		 752 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  28.64 
 
 		 752 aa  171  5e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  25.18 
 
 		 714 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.54 
 
 		 893 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.85 
 
 		 900 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  28.8 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.8 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.8 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  28.8 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  28.8 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  28.8 
 
 		 715 aa  167  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.57 
 
 		 685 aa  167  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5401  molybdopterin oxidoreductase  24.6 
 
 		 1228 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  24.18 
 
 		 700 aa  167  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.63 
 
 		 886 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.63 
 
 		 886 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.44 
 
 		 1110 aa  165  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.6 
 
 		 668 aa  165  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.31 
 
 		 886 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.41 
 
 		 723 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.31 
 
 		 886 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  24.9 
 
 		 905 aa  164  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.14 
 
 		 689 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0923  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 		 621 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000228459 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.37 
 
 		 676 aa  163  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>