More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2721 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  82.3 
 
 
753 aa  1186    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  79.18 
 
 
749 aa  1145    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  55.27 
 
 
757 aa  719    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  100 
 
 
752 aa  1538    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  52.55 
 
 
769 aa  751    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  98.4 
 
 
752 aa  1516    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  100 
 
 
752 aa  1538    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  83.71 
 
 
754 aa  1239    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.3 
 
 
804 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.3 
 
 
773 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.3 
 
 
804 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.3 
 
 
777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  45.17 
 
 
777 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  45.17 
 
 
804 aa  582  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.29 
 
 
849 aa  581  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  45.56 
 
 
769 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  33.42 
 
 
747 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  33.64 
 
 
746 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  32.93 
 
 
835 aa  332  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  29.01 
 
 
725 aa  253  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  28.42 
 
 
733 aa  252  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  29.25 
 
 
743 aa  251  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  28.23 
 
 
715 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  26.32 
 
 
729 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  26.53 
 
 
702 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  26.26 
 
 
702 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  26.26 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  28.73 
 
 
691 aa  199  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  25.93 
 
 
702 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  26.11 
 
 
720 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  29.18 
 
 
702 aa  194  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  24.93 
 
 
732 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  26.39 
 
 
721 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  26.25 
 
 
721 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  29.18 
 
 
702 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  26.25 
 
 
721 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  27.73 
 
 
739 aa  190  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  27.98 
 
 
773 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  25.13 
 
 
713 aa  189  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  28.99 
 
 
717 aa  187  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 
701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  25.35 
 
 
720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  28.64 
 
 
726 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 
704 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  28.16 
 
 
702 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.31 
 
 
732 aa  182  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  28.72 
 
 
702 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  25.62 
 
 
764 aa  181  4.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  26.93 
 
 
739 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  28.75 
 
 
733 aa  175  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  26.99 
 
 
747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  26.34 
 
 
727 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  30.15 
 
 
739 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  26.17 
 
 
753 aa  169  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  27.46 
 
 
731 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  29.18 
 
 
687 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  27.48 
 
 
738 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.69 
 
 
657 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  25.26 
 
 
741 aa  154  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.52 
 
 
657 aa  152  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.18 
 
 
732 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3992  molybdopterin oxidoreductase  43.62 
 
 
197 aa  151  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  30.22 
 
 
768 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  26.37 
 
 
1299 aa  150  7e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  25.89 
 
 
671 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3530  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 
931 aa  150  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.77 
 
 
668 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.03 
 
 
721 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  27.39 
 
 
738 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.4 
 
 
722 aa  149  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 
726 aa  148  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  27.01 
 
 
726 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 
891 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 
726 aa  145  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2301  nitrate reductase  26.76 
 
 
908 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421585  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2559  molybdopterin oxidoreductase  29.48 
 
 
958 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
673 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3132  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 
951 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0821  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.94 
 
 
985 aa  142  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.366025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0101  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 
951 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2917  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 
951 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3718  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
896 aa  142  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0556  nitrate reductase  28.1 
 
 
951 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  24.67 
 
 
729 aa  142  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1488  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 
951 aa  142  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0739  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 
951 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0571  nitrate reductase  28.1 
 
 
951 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.46294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0462  molybdopterin oxidoreductase family protein  28.1 
 
 
951 aa  140  6e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.73 
 
 
708 aa  140  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  27.75 
 
 
693 aa  139  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2380  molybdopterin oxidoreductase  24.57 
 
 
1188 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.291899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
1180 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4863  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.09 
 
 
906 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2094  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  27.07 
 
 
905 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0428437  normal  0.0964557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  24.87 
 
 
757 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 
708 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1799  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 
662 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.381275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1518  molybdopterin oxidoreductase  23.22 
 
 
662 aa  138  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.403527  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.95 
 
 
927 aa  138  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>