More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2187 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  58.22 
 
 
743 aa  796    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
725 aa  1440    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  52.76 
 
 
727 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  57.7 
 
 
715 aa  778    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  58.36 
 
 
733 aa  800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  52.17 
 
 
726 aa  691    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  41.82 
 
 
747 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  37.05 
 
 
717 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  37.97 
 
 
691 aa  466  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  39.43 
 
 
739 aa  459  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  36.32 
 
 
764 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.24 
 
 
733 aa  454  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  39.39 
 
 
702 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  39.94 
 
 
702 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  39.27 
 
 
702 aa  445  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  40.22 
 
 
739 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  38.04 
 
 
701 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  33.7 
 
 
726 aa  439  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  33.7 
 
 
729 aa  432  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  34.46 
 
 
704 aa  436  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  35.24 
 
 
713 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.82 
 
 
773 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  38.82 
 
 
739 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  37.01 
 
 
738 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  37.01 
 
 
702 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  37.24 
 
 
702 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.46 
 
 
732 aa  425  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  34.03 
 
 
741 aa  422  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  34.53 
 
 
1299 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  37.41 
 
 
702 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  38.04 
 
 
702 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  37.59 
 
 
702 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  35.75 
 
 
732 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  37.48 
 
 
757 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  37.34 
 
 
687 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.61 
 
 
721 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  39.7 
 
 
731 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  37.15 
 
 
753 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  37.03 
 
 
721 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  37.17 
 
 
721 aa  379  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  37.03 
 
 
721 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  36.58 
 
 
720 aa  379  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  35.67 
 
 
720 aa  354  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  45.48 
 
 
768 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 
773 aa  296  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 
777 aa  296  8e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 
777 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 
849 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.38 
 
 
769 aa  296  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  31.18 
 
 
804 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 
804 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  31.18 
 
 
804 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  32.55 
 
 
679 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  29.72 
 
 
671 aa  250  7e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  30.16 
 
 
754 aa  245  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  29.44 
 
 
752 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  29.17 
 
 
738 aa  242  1e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  29.44 
 
 
752 aa  241  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  29.44 
 
 
752 aa  241  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  30.65 
 
 
753 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  30.01 
 
 
769 aa  237  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  32.88 
 
 
749 aa  220  6e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  28.59 
 
 
698 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 
747 aa  213  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0402  formate dehydrogenase  30.46 
 
 
693 aa  213  9e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  32.92 
 
 
746 aa  209  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.53 
 
 
688 aa  207  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1073  molydopterin dinucleotide-binding region  29.01 
 
 
835 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.97 
 
 
685 aa  206  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  30.52 
 
 
673 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  29.74 
 
 
684 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8953  reductase  29.53 
 
 
674 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.4 
 
 
688 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0031  molybdopterin dinucleotide-binding region  29.01 
 
 
679 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.93 
 
 
917 aa  199  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2997  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.05 
 
 
757 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.312767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.22 
 
 
688 aa  197  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3041  molybdopterin oxidoreductase  28.43 
 
 
674 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.70523 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.78 
 
 
676 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.1 
 
 
730 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.35 
 
 
668 aa  196  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.9 
 
 
692 aa  193  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.92 
 
 
676 aa  193  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 
759 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.99 
 
 
676 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.61 
 
 
766 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.66 
 
 
687 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.34 
 
 
686 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  29.68 
 
 
714 aa  189  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 
691 aa  188  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  27.1 
 
 
731 aa  187  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.26 
 
 
657 aa  187  8e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25.56 
 
 
685 aa  186  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  28.02 
 
 
731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2801  molybdopterin oxidoreductase  30.41 
 
 
715 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000856519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
691 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 
697 aa  186  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2414  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 
706 aa  185  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00180215  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 
694 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.3 
 
 
900 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>